25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_3297 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_3297  YfaZ family protein  100 
 
 		 179 aa  363  1e-100  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.842985  decreased coverage  0.0000000230689 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3446  YfaZ family protein  82.72 
 
 		 179 aa  279  2e-74  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.055004 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2962  YfaZ family protein  63.13 
 
 		 179 aa  242  3e-63  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2740  YfaZ family protein  67.08 
 
 		 177 aa  231  4.0000000000000004e-60  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000342783  hitchhiker  0.0000615291 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2702  YfaZ family protein  58.24 
 
 		 179 aa  223  1e-57  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000258539  hitchhiker  0.0000794475 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1568  hypothetical protein  58.82 
 
 		 179 aa  223  2e-57  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2770  YfaZ family protein  58.82 
 
 		 179 aa  222  2e-57  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000254967  normal  0.114256 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1303  YfaZ family protein  56.4 
 
 		 179 aa  221  4e-57  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2872  YfaZ family protein  58.24 
 
 		 179 aa  221  6e-57  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00022374  hitchhiker  0.00192784 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1387  YfaZ family protein  55.88 
 
 		 179 aa  218  3e-56  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1371  YfaZ family protein  55.88 
 
 		 179 aa  218  3e-56  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.376788  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2972  YfaZ family protein  55.29 
 
 		 179 aa  216  1e-55  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.285706  normal  0.104145 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1410  YfaZ family protein  55.29 
 
 		 179 aa  216  1e-55  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.71685  normal  0.181504 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0027  YfaZ family protein  22.53 
 
 		 191 aa  53.5  0.000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2638  putative inner membrane protein  28.24 
 
 		 224 aa  45.1  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2479  hypothetical protein  28.24 
 
 		 224 aa  44.7  0.0008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2534  hypothetical protein  28.24 
 
 		 224 aa  44.7  0.0008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2430  putative inner membrane protein  28.24 
 
 		 224 aa  44.3  0.0009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3392  YfaZ family protein  30 
 
 		 181 aa  44.3  0.001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2231  YfaZ family protein  29.07 
 
 		 187 aa  43.9  0.001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0687598  normal  0.632442 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2334  YfaZ family protein  21.64 
 
 		 190 aa  42.7  0.003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.6281  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2522  YfaZ superfamily  27.48 
 
 		 224 aa  42.7  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.760699  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0132  YfaZ  22.12 
 
 		 197 aa  42  0.004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00180457  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2689  YfaZ family protein  23.46 
 
 		 186 aa  41.6  0.006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.673529  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2505  YfaZ family protein  24.11 
 
 		 189 aa  41.2  0.009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.634002  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>