23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_2962 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009901  Spea_2962  YfaZ family protein  100 
 
 
179 aa  362  1e-99  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3297  YfaZ family protein  63.13 
 
 
179 aa  242  3e-63  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.842985  decreased coverage  0.0000000230689 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3446  YfaZ family protein  62.73 
 
 
179 aa  225  3e-58  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.055004 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2770  YfaZ family protein  50.28 
 
 
179 aa  207  9e-53  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000254967  normal  0.114256 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2872  YfaZ family protein  49.72 
 
 
179 aa  205  3e-52  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00022374  hitchhiker  0.00192784 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1568  hypothetical protein  49.16 
 
 
179 aa  202  2e-51  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2702  YfaZ family protein  48.6 
 
 
179 aa  201  3e-51  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000258539  hitchhiker  0.0000794475 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1387  YfaZ family protein  49.16 
 
 
179 aa  202  3e-51  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1371  YfaZ family protein  49.16 
 
 
179 aa  202  3e-51  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.376788  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2972  YfaZ family protein  49.16 
 
 
179 aa  201  5e-51  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.285706  normal  0.104145 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1410  YfaZ family protein  49.16 
 
 
179 aa  201  5e-51  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.71685  normal  0.181504 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2740  YfaZ family protein  53.11 
 
 
177 aa  200  9.999999999999999e-51  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000342783  hitchhiker  0.0000615291 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1303  YfaZ family protein  48.28 
 
 
179 aa  197  7e-50  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0027  YfaZ family protein  24.48 
 
 
191 aa  53.9  0.000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0132  YfaZ  25 
 
 
197 aa  52  0.000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00180457  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2505  YfaZ family protein  27.66 
 
 
189 aa  48.1  0.00006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.634002  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2231  YfaZ family protein  32.91 
 
 
187 aa  48.1  0.00007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0687598  normal  0.632442 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2334  YfaZ family protein  23.39 
 
 
190 aa  46.6  0.0002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.6281  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2775  putative outer membrane protein  24.86 
 
 
180 aa  44.7  0.0008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1319  hypothetical protein  24.86 
 
 
180 aa  44.7  0.0008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2854  YfaZ family protein  24.86 
 
 
180 aa  44.7  0.0008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2689  YfaZ family protein  32.95 
 
 
186 aa  42.7  0.003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.673529  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3392  YfaZ family protein  31.53 
 
 
181 aa  41.2  0.009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>