17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hhal_2334 on replicon NC_008789
Organism: Halorhodospira halophila SL1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008789  Hhal_2334  YfaZ family protein  100 
 
 		 190 aa  384  1e-106  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.6281  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0027  YfaZ family protein  39.58 
 
 		 191 aa  132  1.9999999999999998e-30  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2505  YfaZ family protein  41.55 
 
 		 189 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.634002  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0132  YfaZ  30.95 
 
 		 197 aa  75.1  0.0000000000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00180457  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1303  YfaZ family protein  25.13 
 
 		 179 aa  53.9  0.000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2962  YfaZ family protein  22.22 
 
 		 179 aa  49.7  0.00003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3446  YfaZ family protein  21.97 
 
 		 179 aa  48.5  0.00006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.055004 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2702  YfaZ family protein  22.99 
 
 		 179 aa  48.1  0.00007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000258539  hitchhiker  0.0000794475 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2872  YfaZ family protein  22.99 
 
 		 179 aa  47.4  0.0001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00022374  hitchhiker  0.00192784 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1387  YfaZ family protein  23.4 
 
 		 179 aa  47.4  0.0001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1371  YfaZ family protein  23.4 
 
 		 179 aa  47.4  0.0001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.376788  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1410  YfaZ family protein  23.4 
 
 		 179 aa  47  0.0002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.71685  normal  0.181504 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2972  YfaZ family protein  23.4 
 
 		 179 aa  47  0.0002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.285706  normal  0.104145 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2770  YfaZ family protein  22.46 
 
 		 179 aa  45.8  0.0004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000254967  normal  0.114256 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3297  YfaZ family protein  21.08 
 
 		 179 aa  45.8  0.0004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.842985  decreased coverage  0.0000000230689 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1568  hypothetical protein  25.26 
 
 		 179 aa  45.1  0.0006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2689  YfaZ family protein  27.17 
 
 		 186 aa  43.5  0.002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.673529  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>