18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcr_0132 on replicon NC_007520
Organism: Thiomicrospira crunogena XCL-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007520  Tcr_0132  YfaZ  100 
 
 		 197 aa  397  9.999999999999999e-111  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00180457  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2505  YfaZ family protein  29.21 
 
 		 189 aa  88.2  7e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.634002  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2334  YfaZ family protein  30.95 
 
 		 190 aa  75.1  0.0000000000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.6281  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0027  YfaZ family protein  28.57 
 
 		 191 aa  68.9  0.00000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2962  YfaZ family protein  25 
 
 		 179 aa  52  0.000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1303  YfaZ family protein  28.32 
 
 		 179 aa  51.2  0.000009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2702  YfaZ family protein  25.41 
 
 		 179 aa  51.2  0.00001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000258539  hitchhiker  0.0000794475 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1387  YfaZ family protein  25.41 
 
 		 179 aa  50.8  0.00001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1371  YfaZ family protein  25.41 
 
 		 179 aa  50.8  0.00001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.376788  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2872  YfaZ family protein  24.59 
 
 		 179 aa  48.9  0.00004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00022374  hitchhiker  0.00192784 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1410  YfaZ family protein  24.59 
 
 		 179 aa  48.9  0.00005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.71685  normal  0.181504 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2972  YfaZ family protein  24.59 
 
 		 179 aa  48.9  0.00005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.285706  normal  0.104145 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2770  YfaZ family protein  25.66 
 
 		 179 aa  47.8  0.0001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000254967  normal  0.114256 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1568  hypothetical protein  27.43 
 
 		 179 aa  47.8  0.0001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2689  YfaZ family protein  26.47 
 
 		 186 aa  47  0.0002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.673529  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3297  YfaZ family protein  22.12 
 
 		 179 aa  42  0.005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.842985  decreased coverage  0.0000000230689 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2740  YfaZ family protein  23.89 
 
 		 177 aa  42  0.007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000342783  hitchhiker  0.0000615291 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3009  YfaZ family protein  25.96 
 
 		 181 aa  41.2  0.01  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>