34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcSMS35_2404 on replicon NC_010498
Organism: Escherichia coli SMS-3-5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009801  EcE24377A_2545  outer membrane protein, YfaZ  100 
 
 		 180 aa  357  6e-98  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2404  outer membrane protein, YfaZ  100 
 
 		 180 aa  357  6e-98  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1408  YfaZ family protein  99.44 
 
 		 180 aa  355  9.999999999999999e-98  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02176  predicted outer membrane porin protein  99.44 
 
 		 180 aa  355  9.999999999999999e-98  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.436146  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02135  hypothetical protein  99.44 
 
 		 180 aa  355  9.999999999999999e-98  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.457898  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1399  YfaZ family protein  99.44 
 
 		 180 aa  355  9.999999999999999e-98  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.296552  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3391  YfaZ protein  99.44 
 
 		 180 aa  355  1.9999999999999998e-97  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2534  hypothetical protein  86.67 
 
 		 224 aa  319  9.999999999999999e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2522  YfaZ superfamily  86.11 
 
 		 224 aa  319  1.9999999999999998e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.760699  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2479  hypothetical protein  86.67 
 
 		 224 aa  318  1.9999999999999998e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2430  putative inner membrane protein  86.67 
 
 		 224 aa  318  1.9999999999999998e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2638  putative inner membrane protein  86.11 
 
 		 224 aa  318  3e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2809  YfaZ family protein  78.89 
 
 		 180 aa  302  2.0000000000000002e-81  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2775  putative outer membrane protein  50.56 
 
 		 180 aa  197  7e-50  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2854  YfaZ family protein  50.56 
 
 		 180 aa  197  7e-50  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1319  hypothetical protein  50.56 
 
 		 180 aa  197  7e-50  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3277  YfaZ family protein  52.22 
 
 		 180 aa  186  2e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3198  YfaZ family protein  45.56 
 
 		 179 aa  169  2e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1117  YfaZ family protein  46.67 
 
 		 179 aa  169  2e-41  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3009  YfaZ family protein  43.09 
 
 		 181 aa  143  1e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1050  YfaZ family protein  40.88 
 
 		 182 aa  136  1e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.354298  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3392  YfaZ family protein  41.21 
 
 		 181 aa  134  7.000000000000001e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0114  YfaZ precursor superfamily protein  30 
 
 		 149 aa  74.7  0.0000000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0148  outer membrane protein  28.26 
 
 		 163 aa  64.7  0.0000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1597  hypothetical protein  26.88 
 
 		 184 aa  60.5  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.261677  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0125  outer membrane protein  28.46 
 
 		 150 aa  57.8  0.00000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1303  YfaZ family protein  26.14 
 
 		 179 aa  44.3  0.0008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2872  YfaZ family protein  26.14 
 
 		 179 aa  44.3  0.0008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00022374  hitchhiker  0.00192784 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2702  YfaZ family protein  26.14 
 
 		 179 aa  44.3  0.001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000258539  hitchhiker  0.0000794475 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1410  YfaZ family protein  25.57 
 
 		 179 aa  42.4  0.004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.71685  normal  0.181504 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2972  YfaZ family protein  25.57 
 
 		 179 aa  42.4  0.004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.285706  normal  0.104145 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1371  YfaZ family protein  25.57 
 
 		 179 aa  42  0.005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.376788  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1387  YfaZ family protein  25.57 
 
 		 179 aa  42  0.005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2770  YfaZ family protein  25.57 
 
 		 179 aa  41.6  0.006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000254967  normal  0.114256 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>