28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_0557 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009901  Spea_0557  putative plasmid transfer protein  100 
 
 		 397 aa  798    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0619  putative plasmid transfer protein  68.51 
 
 		 397 aa  567  1e-160  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0517  putative plasmid transfer protein  66.84 
 
 		 398 aa  503  1e-141  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.359059  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3174  putative outer membrane or exported  52.14 
 
 		 397 aa  437  1e-121  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4044  putative plasmid transfer protein  44.17 
 
 		 357 aa  316  6e-85  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4636  conjugative transfer protein  36.49 
 
 		 436 aa  267  2.9999999999999995e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.403008  normal  0.321234 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4585  conjugative transfer protein  36.49 
 
 		 436 aa  267  2.9999999999999995e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.774024 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4499  conjugative transfer protein  36.49 
 
 		 436 aa  266  4e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4434  conjugative transfer protein  36.49 
 
 		 436 aa  266  4e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.413402  hitchhiker  0.00000046474 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4584  conjugative transfer protein  36.26 
 
 		 436 aa  266  5e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0252  conjugative transfer protein  36.34 
 
 		 436 aa  256  4e-67  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.34685  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3221  putative plasmid transfer protein  36.1 
 
 		 415 aa  238  1e-61  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0051  putative plasmid transfer protein  35.06 
 
 		 396 aa  226  6e-58  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.00000000649628  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0705  putative plasmid transfer protein  34.61 
 
 		 399 aa  223  6e-57  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0529  putative plasmid transfer protein  34.5 
 
 		 398 aa  221  1.9999999999999999e-56  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000622443  n/a   
 
 
-
 
NC_011081  SeHA_A0106  TraF  32.17 
 
 		 400 aa  196  5.000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000817  hypothetical protein  30.46 
 
 		 375 aa  159  1e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.529615  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0674  hypothetical protein  28.83 
 
 		 413 aa  150  3e-35  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4649  hypothetical protein  31.44 
 
 		 266 aa  144  2e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0502  hypothetical protein  30.29 
 
 		 388 aa  141  1.9999999999999998e-32  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00214405  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2920  hypothetical protein  29.23 
 
 		 380 aa  140  3.9999999999999997e-32  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.448898 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000131  TraF-related protein  28.75 
 
 		 373 aa  130  4.0000000000000003e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00236694  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05738  hypothetical protein  31.67 
 
 		 373 aa  130  5.0000000000000004e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4490  hypothetical protein  25.43 
 
 		 421 aa  121  1.9999999999999998e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3650  ribonuclease PH  26.4 
 
 		 428 aa  96.7  7e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4405  hypothetical protein  26.75 
 
 		 509 aa  55.8  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000142257  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0612  hypothetical protein  33.85 
 
 		 217 aa  54.3  0.000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0790  hypothetical protein  26.24 
 
 		 512 aa  50.8  0.00004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>