26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeHA_A0106 on replicon NC_011081
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011081  SeHA_A0106  TraF  100 
 
 		 400 aa  810    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4649  hypothetical protein  76.32 
 
 		 266 aa  427  1e-118  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0705  putative plasmid transfer protein  54.39 
 
 		 399 aa  419  1e-116  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3221  putative plasmid transfer protein  46.15 
 
 		 415 aa  370  1e-101  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0252  conjugative transfer protein  37.84 
 
 		 436 aa  301  2e-80  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.34685  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4585  conjugative transfer protein  37.61 
 
 		 436 aa  295  7e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.774024 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4636  conjugative transfer protein  37.61 
 
 		 436 aa  295  7e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.403008  normal  0.321234 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4584  conjugative transfer protein  37.39 
 
 		 436 aa  295  8e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4499  conjugative transfer protein  37.61 
 
 		 436 aa  295  1e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4434  conjugative transfer protein  37.39 
 
 		 436 aa  294  2e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.413402  hitchhiker  0.00000046474 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0051  putative plasmid transfer protein  38.46 
 
 		 396 aa  264  2e-69  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.00000000649628  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0529  putative plasmid transfer protein  34.55 
 
 		 398 aa  248  1e-64  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000622443  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0557  putative plasmid transfer protein  32.5 
 
 		 397 aa  211  2e-53  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0619  putative plasmid transfer protein  32.39 
 
 		 397 aa  206  6e-52  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2920  hypothetical protein  32.47 
 
 		 380 aa  202  9.999999999999999e-51  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.448898 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0674  hypothetical protein  32.91 
 
 		 413 aa  194  3e-48  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000817  hypothetical protein  34.14 
 
 		 375 aa  192  9e-48  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.529615  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3174  putative outer membrane or exported  31.02 
 
 		 397 aa  191  2e-47  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0517  putative plasmid transfer protein  31.93 
 
 		 398 aa  173  5e-42  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.359059  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0502  hypothetical protein  29.27 
 
 		 388 aa  148  2.0000000000000003e-34  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00214405  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000131  TraF-related protein  29.57 
 
 		 373 aa  143  7e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00236694  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4490  hypothetical protein  28.72 
 
 		 421 aa  132  7.999999999999999e-30  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05738  hypothetical protein  28.24 
 
 		 373 aa  131  2.0000000000000002e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4044  putative plasmid transfer protein  26.7 
 
 		 357 aa  116  6.9999999999999995e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3650  ribonuclease PH  26.86 
 
 		 428 aa  107  3e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0790  hypothetical protein  27.54 
 
 		 512 aa  50.4  0.00005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>