29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_3174 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008700  Sama_3174  putative outer membrane or exported  100 
 
 		 397 aa  792    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0557  putative plasmid transfer protein  52.14 
 
 		 397 aa  420  1e-116  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0619  putative plasmid transfer protein  51.39 
 
 		 397 aa  416  9.999999999999999e-116  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0517  putative plasmid transfer protein  52.67 
 
 		 398 aa  387  1e-106  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.359059  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4044  putative plasmid transfer protein  42.64 
 
 		 357 aa  232  1e-59  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4585  conjugative transfer protein  32.41 
 
 		 436 aa  219  8.999999999999998e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.774024 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4636  conjugative transfer protein  32.41 
 
 		 436 aa  219  8.999999999999998e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.403008  normal  0.321234 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4499  conjugative transfer protein  32.41 
 
 		 436 aa  218  1e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4584  conjugative transfer protein  32.41 
 
 		 436 aa  218  2e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4434  conjugative transfer protein  32.18 
 
 		 436 aa  217  2.9999999999999998e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.413402  hitchhiker  0.00000046474 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0705  putative plasmid transfer protein  31.84 
 
 		 399 aa  207  3e-52  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0252  conjugative transfer protein  30.25 
 
 		 436 aa  200  3.9999999999999996e-50  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.34685  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0529  putative plasmid transfer protein  30.98 
 
 		 398 aa  199  5e-50  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000622443  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3221  putative plasmid transfer protein  32.92 
 
 		 415 aa  199  6e-50  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0051  putative plasmid transfer protein  31.72 
 
 		 396 aa  198  2.0000000000000003e-49  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.00000000649628  n/a   
 
 
-
 
NC_011081  SeHA_A0106  TraF  31.02 
 
 		 400 aa  172  1e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2920  hypothetical protein  29.87 
 
 		 380 aa  140  3.9999999999999997e-32  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.448898 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0502  hypothetical protein  27.68 
 
 		 388 aa  139  7e-32  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00214405  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0674  hypothetical protein  26.38 
 
 		 413 aa  137  4e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4649  hypothetical protein  31.82 
 
 		 266 aa  137  4e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000817  hypothetical protein  28.78 
 
 		 375 aa  130  5.0000000000000004e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.529615  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000131  TraF-related protein  27.57 
 
 		 373 aa  126  7e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00236694  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4490  hypothetical protein  27.1 
 
 		 421 aa  125  2e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05738  hypothetical protein  28.05 
 
 		 373 aa  113  8.000000000000001e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3650  ribonuclease PH  23.18 
 
 		 428 aa  74.7  0.000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4405  hypothetical protein  28.06 
 
 		 509 aa  62.4  0.00000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000142257  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0612  hypothetical protein  30.3 
 
 		 217 aa  52  0.00002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0790  hypothetical protein  26.97 
 
 		 512 aa  43.9  0.005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1164  hypothetical protein  34.29 
 
 		 465 aa  43.1  0.009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0613259  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>