26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_0674 on replicon NC_009456
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009456  VC0395_0674  hypothetical protein  100 
 
 		 413 aa  833    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2920  hypothetical protein  51.31 
 
 		 380 aa  402  1e-111  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.448898 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000817  hypothetical protein  50.84 
 
 		 375 aa  376  1e-103  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.529615  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0502  hypothetical protein  31.62 
 
 		 388 aa  210  3e-53  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00214405  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000131  TraF-related protein  31.14 
 
 		 373 aa  201  1.9999999999999998e-50  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00236694  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05738  hypothetical protein  31.14 
 
 		 373 aa  200  3e-50  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0529  putative plasmid transfer protein  30.42 
 
 		 398 aa  190  4e-47  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000622443  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0705  putative plasmid transfer protein  31.71 
 
 		 399 aa  185  2.0000000000000003e-45  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0051  putative plasmid transfer protein  31.51 
 
 		 396 aa  179  5.999999999999999e-44  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.00000000649628  n/a   
 
 
-
 
NC_011081  SeHA_A0106  TraF  32.66 
 
 		 400 aa  179  5.999999999999999e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4434  conjugative transfer protein  28.38 
 
 		 436 aa  167  5e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.413402  hitchhiker  0.00000046474 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4584  conjugative transfer protein  28.31 
 
 		 436 aa  166  5e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4636  conjugative transfer protein  28.38 
 
 		 436 aa  166  5.9999999999999996e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.403008  normal  0.321234 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4585  conjugative transfer protein  28.38 
 
 		 436 aa  166  5.9999999999999996e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.774024 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4499  conjugative transfer protein  28.38 
 
 		 436 aa  166  8e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0252  conjugative transfer protein  26.05 
 
 		 436 aa  154  2.9999999999999998e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.34685  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3221  putative plasmid transfer protein  30.23 
 
 		 415 aa  152  1e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0557  putative plasmid transfer protein  28.83 
 
 		 397 aa  146  8.000000000000001e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0619  putative plasmid transfer protein  27.14 
 
 		 397 aa  137  2e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3174  putative outer membrane or exported  26.38 
 
 		 397 aa  137  4e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4649  hypothetical protein  32.83 
 
 		 266 aa  128  2.0000000000000002e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0517  putative plasmid transfer protein  27.32 
 
 		 398 aa  114  3e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.359059  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4490  hypothetical protein  25 
 
 		 421 aa  98.6  2e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4044  putative plasmid transfer protein  27.71 
 
 		 357 aa  95.1  2e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3650  ribonuclease PH  25.61 
 
 		 428 aa  87  5e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0790  hypothetical protein  23.89 
 
 		 512 aa  45.8  0.001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>