27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ent638_0252 on replicon NC_009436
Organism: Enterobacter sp. 638



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011149  SeAg_B4499  conjugative transfer protein  78.21 
 
 		 436 aa  704    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4585  conjugative transfer protein  78.44 
 
 		 436 aa  706    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.774024 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4584  conjugative transfer protein  77.98 
 
 		 436 aa  704    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4434  conjugative transfer protein  78.21 
 
 		 436 aa  704    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.413402  hitchhiker  0.00000046474 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4636  conjugative transfer protein  78.44 
 
 		 436 aa  706    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.403008  normal  0.321234 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0252  conjugative transfer protein  100 
 
 		 436 aa  875    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.34685  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3221  putative plasmid transfer protein  42.11 
 
 		 415 aa  308  1.0000000000000001e-82  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0705  putative plasmid transfer protein  41.88 
 
 		 399 aa  303  3.0000000000000004e-81  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011081  SeHA_A0106  TraF  38.3 
 
 		 400 aa  283  5.000000000000001e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0051  putative plasmid transfer protein  39.32 
 
 		 396 aa  275  1.0000000000000001e-72  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.00000000649628  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0619  putative plasmid transfer protein  37.76 
 
 		 397 aa  256  6e-67  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0557  putative plasmid transfer protein  35.88 
 
 		 397 aa  253  3e-66  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0529  putative plasmid transfer protein  31.58 
 
 		 398 aa  209  5e-53  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000622443  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4649  hypothetical protein  38.33 
 
 		 266 aa  209  1e-52  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0517  putative plasmid transfer protein  35.37 
 
 		 398 aa  201  1.9999999999999998e-50  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.359059  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3174  putative outer membrane or exported  30.25 
 
 		 397 aa  200  3.9999999999999996e-50  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000131  TraF-related protein  29.68 
 
 		 373 aa  176  5e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00236694  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000817  hypothetical protein  30.32 
 
 		 375 aa  173  5.999999999999999e-42  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.529615  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05738  hypothetical protein  29.22 
 
 		 373 aa  171  2e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2920  hypothetical protein  29.26 
 
 		 380 aa  171  3e-41  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.448898 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0502  hypothetical protein  29.21 
 
 		 388 aa  165  1.0000000000000001e-39  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00214405  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0674  hypothetical protein  26.05 
 
 		 413 aa  154  4e-36  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4490  hypothetical protein  27.32 
 
 		 421 aa  132  1.0000000000000001e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4044  putative plasmid transfer protein  33.33 
 
 		 357 aa  132  2.0000000000000002e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3650  ribonuclease PH  27.38 
 
 		 428 aa  106  8e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4405  hypothetical protein  31.58 
 
 		 509 aa  52  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000142257  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0790  hypothetical protein  28.09 
 
 		 512 aa  49.7  0.0001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>