25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sputcn32_0051 on replicon NC_009438
Organism: Shewanella putrefaciens CN-32



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009438  Sputcn32_0051  putative plasmid transfer protein  100 
 
 		 396 aa  792    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.00000000649628  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0252  conjugative transfer protein  39.32 
 
 		 436 aa  287  2e-76  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.34685  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0705  putative plasmid transfer protein  42.01 
 
 		 399 aa  280  3e-74  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4434  conjugative transfer protein  38.18 
 
 		 436 aa  276  4e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.413402  hitchhiker  0.00000046474 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4636  conjugative transfer protein  38.18 
 
 		 436 aa  276  5e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.403008  normal  0.321234 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4584  conjugative transfer protein  38.18 
 
 		 436 aa  276  5e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4585  conjugative transfer protein  38.18 
 
 		 436 aa  276  5e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.774024 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4499  conjugative transfer protein  38.18 
 
 		 436 aa  275  1.0000000000000001e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0529  putative plasmid transfer protein  38.12 
 
 		 398 aa  266  5e-70  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000622443  n/a   
 
 
-
 
NC_011081  SeHA_A0106  TraF  38.46 
 
 		 400 aa  260  3e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3221  putative plasmid transfer protein  36.65 
 
 		 415 aa  247  3e-64  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0619  putative plasmid transfer protein  34.49 
 
 		 397 aa  236  4e-61  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0557  putative plasmid transfer protein  34.57 
 
 		 397 aa  231  2e-59  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3174  putative outer membrane or exported  31.72 
 
 		 397 aa  209  1e-52  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0517  putative plasmid transfer protein  33.33 
 
 		 398 aa  196  5.000000000000001e-49  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.359059  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000817  hypothetical protein  32.8 
 
 		 375 aa  191  2.9999999999999997e-47  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.529615  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2920  hypothetical protein  33.42 
 
 		 380 aa  188  1e-46  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.448898 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4649  hypothetical protein  36.4 
 
 		 266 aa  187  3e-46  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0674  hypothetical protein  31.76 
 
 		 413 aa  186  4e-46  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000131  TraF-related protein  30.54 
 
 		 373 aa  169  6e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00236694  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0502  hypothetical protein  30.53 
 
 		 388 aa  166  8e-40  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00214405  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05738  hypothetical protein  31.36 
 
 		 373 aa  163  5.0000000000000005e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4490  hypothetical protein  26.07 
 
 		 421 aa  150  5e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4044  putative plasmid transfer protein  33.48 
 
 		 357 aa  137  2e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3650  ribonuclease PH  28.28 
 
 		 428 aa  100  4e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>