13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_4405 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_4405  hypothetical protein  100 
 
 		 509 aa  1033    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000142257  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0790  hypothetical protein  41.58 
 
 		 512 aa  342  9e-93  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3174  putative outer membrane or exported  28.06 
 
 		 397 aa  62.4  0.00000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0557  putative plasmid transfer protein  26.75 
 
 		 397 aa  55.8  0.000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0502  hypothetical protein  30.54 
 
 		 388 aa  52.4  0.00002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00214405  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0252  conjugative transfer protein  31.58 
 
 		 436 aa  52  0.00003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.34685  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0529  putative plasmid transfer protein  25.61 
 
 		 398 aa  50.4  0.00007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000622443  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05738  hypothetical protein  29.86 
 
 		 373 aa  48.9  0.0002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3221  putative plasmid transfer protein  31.08 
 
 		 415 aa  49.3  0.0002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000131  TraF-related protein  28.31 
 
 		 373 aa  49.3  0.0002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00236694  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0810  hypothetical protein  26.26 
 
 		 435 aa  46.2  0.001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.38258  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0619  putative plasmid transfer protein  25.18 
 
 		 397 aa  45.8  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0705  putative plasmid transfer protein  25.43 
 
 		 399 aa  43.9  0.007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>