26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_0502 on replicon NC_009456
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009456  VC0395_0502  hypothetical protein  100 
 
 		 388 aa  785    Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00214405  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000131  TraF-related protein  55.32 
 
 		 373 aa  434  1e-120  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00236694  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05738  hypothetical protein  55.73 
 
 		 373 aa  430  1e-119  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000817  hypothetical protein  37.89 
 
 		 375 aa  242  7.999999999999999e-63  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.529615  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2920  hypothetical protein  33.42 
 
 		 380 aa  220  3.9999999999999997e-56  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.448898 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0674  hypothetical protein  31.62 
 
 		 413 aa  210  3e-53  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0529  putative plasmid transfer protein  35.47 
 
 		 398 aa  192  9e-48  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000622443  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4636  conjugative transfer protein  30.97 
 
 		 436 aa  167  2e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.403008  normal  0.321234 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4584  conjugative transfer protein  30.73 
 
 		 436 aa  167  2e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4585  conjugative transfer protein  30.97 
 
 		 436 aa  167  2e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.774024 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0705  putative plasmid transfer protein  32.8 
 
 		 399 aa  167  4e-40  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4499  conjugative transfer protein  30.97 
 
 		 436 aa  167  4e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4434  conjugative transfer protein  30.97 
 
 		 436 aa  167  4e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.413402  hitchhiker  0.00000046474 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0252  conjugative transfer protein  29.21 
 
 		 436 aa  165  1.0000000000000001e-39  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.34685  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0051  putative plasmid transfer protein  29.5 
 
 		 396 aa  152  1e-35  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.00000000649628  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3221  putative plasmid transfer protein  30.25 
 
 		 415 aa  146  5e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0557  putative plasmid transfer protein  29.87 
 
 		 397 aa  141  1.9999999999999998e-32  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3174  putative outer membrane or exported  27.68 
 
 		 397 aa  139  6e-32  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011081  SeHA_A0106  TraF  29.02 
 
 		 400 aa  138  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0619  putative plasmid transfer protein  28.43 
 
 		 397 aa  138  2e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0517  putative plasmid transfer protein  29.18 
 
 		 398 aa  117  3e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.359059  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4649  hypothetical protein  29.24 
 
 		 266 aa  98.2  2e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4044  putative plasmid transfer protein  24.56 
 
 		 357 aa  97.1  5e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3650  ribonuclease PH  25.53 
 
 		 428 aa  81.3  0.00000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4490  hypothetical protein  24.08 
 
 		 421 aa  69.7  0.00000000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4405  hypothetical protein  30.54 
 
 		 509 aa  52.4  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000142257  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>