17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cag_0790 on replicon NC_007514
Organism: Chlorobium chlorochromatii CaD3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007514  Cag_0790  hypothetical protein  100 
 
 		 512 aa  1012    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4405  hypothetical protein  41.29 
 
 		 509 aa  356  5.999999999999999e-97  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000142257  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1892  ThiS, thiamine-biosynthesis  28.07 
 
 		 462 aa  62.8  0.00000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2064  ThiS, thiamine-biosynthesis  22.86 
 
 		 440 aa  56.2  0.000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4585  conjugative transfer protein  25.25 
 
 		 436 aa  52.4  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.774024 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4434  conjugative transfer protein  25.25 
 
 		 436 aa  52.4  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.413402  hitchhiker  0.00000046474 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4636  conjugative transfer protein  25.25 
 
 		 436 aa  52.4  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.403008  normal  0.321234 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4499  conjugative transfer protein  25.25 
 
 		 436 aa  51.6  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0557  putative plasmid transfer protein  26.24 
 
 		 397 aa  51.2  0.00004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0252  conjugative transfer protein  23.23 
 
 		 436 aa  50.8  0.00006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.34685  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4584  conjugative transfer protein  27.88 
 
 		 436 aa  49.7  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0674  hypothetical protein  23.89 
 
 		 413 aa  46.2  0.001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011081  SeHA_A0106  TraF  27.78 
 
 		 400 aa  45.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0045  hypothetical protein  26.5 
 
 		 422 aa  44.3  0.005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000224806  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3174  putative outer membrane or exported  26.97 
 
 		 397 aa  44.3  0.006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3221  putative plasmid transfer protein  26.55 
 
 		 415 aa  43.9  0.007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0529  putative plasmid transfer protein  25.1 
 
 		 398 aa  43.5  0.008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000622443  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>