More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_1821 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_1821  FolC bifunctional protein  100 
 
 
428 aa  847    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.505813 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1456  FolC bifunctional protein  42.89 
 
 
461 aa  247  3e-64  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.363059  normal  0.651546 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23910  folylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  38.94 
 
 
466 aa  238  2e-61  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.290984  normal  0.331564 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0971  FolC bifunctional protein  39.89 
 
 
463 aa  233  4.0000000000000004e-60  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.764071  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3497  FolC bifunctional protein  42.86 
 
 
526 aa  227  3e-58  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1149  FolC bifunctional protein  40.45 
 
 
468 aa  216  7e-55  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.498576  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1166  FolC bifunctional protein  40.62 
 
 
452 aa  214  1.9999999999999998e-54  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.343564  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0758  FolC bifunctional protein  32.21 
 
 
443 aa  214  2.9999999999999995e-54  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3492  FolC bifunctional protein  40.33 
 
 
444 aa  213  5.999999999999999e-54  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.371874 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5271  FolC bifunctional protein  40.68 
 
 
468 aa  212  1e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.73776  normal  0.0925623 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12473  folylpolyglutamate synthase protein folC  38.46 
 
 
487 aa  211  2e-53  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.669208 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0742  FolC bifunctional protein  41.49 
 
 
445 aa  210  5e-53  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0127305  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09160  folylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  38.28 
 
 
464 aa  209  6e-53  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.2219 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1536  FolC bifunctional protein  36.53 
 
 
471 aa  209  7e-53  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00142339  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0218  folylpolyglutamate synthase  39.37 
 
 
543 aa  209  8e-53  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.296373  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1159  FolC bifunctional protein  39.21 
 
 
448 aa  208  2e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.728641  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3871  FolC bifunctional protein  39.86 
 
 
444 aa  206  7e-52  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000822129 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1582  FolC bifunctional protein  38.3 
 
 
447 aa  204  2e-51  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2054  FolC bifunctional protein  37.8 
 
 
508 aa  204  3e-51  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.832058  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12370  folylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  37.3 
 
 
470 aa  202  7e-51  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.867028  normal  0.34816 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1885  FolC bifunctional protein  31.63 
 
 
441 aa  200  5e-50  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2209  FolC bifunctional protein  31.13 
 
 
429 aa  199  9e-50  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.791737  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3391  FolC bifunctional protein  37.85 
 
 
450 aa  198  1.0000000000000001e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2552  FolC bifunctional protein  34.69 
 
 
431 aa  198  1.0000000000000001e-49  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0970266  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7286  FolC bifunctional protein  37.5 
 
 
440 aa  198  2.0000000000000003e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0401599  normal  0.82683 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3345  FolC bifunctional protein  33.82 
 
 
429 aa  197  4.0000000000000005e-49  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.63219  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10060  folylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  41.84 
 
 
517 aa  196  6e-49  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0614785  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1496  FolC bifunctional protein  38.94 
 
 
515 aa  196  7e-49  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.038753  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2567  FolC bifunctional protein  41.16 
 
 
477 aa  196  7e-49  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0405628 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1456  FolC bifunctional protein  30.68 
 
 
438 aa  196  8.000000000000001e-49  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2174  FolC bifunctional protein  30.9 
 
 
441 aa  196  8.000000000000001e-49  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1648  hypothetical protein  32.37 
 
 
416 aa  195  1e-48  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3470  FolC bifunctional protein  38.67 
 
 
460 aa  195  1e-48  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.00143451  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0464  bifunctional protein FolC  38.07 
 
 
485 aa  194  2e-48  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2764  FolC bifunctional protein  32.92 
 
 
424 aa  193  6e-48  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2190  folylpolyglutamate synthetase  39.72 
 
 
443 aa  191  2e-47  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.400499  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1671  FolC bifunctional protein  33.5 
 
 
431 aa  191  2e-47  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.239696  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1447  FolC bifunctional protein  31.6 
 
 
424 aa  190  5e-47  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7289  FolC bifunctional protein  39.81 
 
 
515 aa  189  8e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2472  FolC bifunctional protein  38.73 
 
 
448 aa  189  9e-47  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.829093 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1490  FolC bifunctional protein  29.58 
 
 
432 aa  186  5e-46  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09900  folylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  36.04 
 
 
462 aa  186  9e-46  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.175662  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2475  folylpolyglutamate synthetase  35.9 
 
 
424 aa  185  2.0000000000000003e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0602  dihydropteroate synthase  38.26 
 
 
813 aa  184  3e-45  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2151  FolC bifunctional protein  36.69 
 
 
452 aa  183  4.0000000000000006e-45  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000358705 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1160  FolC bifunctional protein  34.46 
 
 
425 aa  184  4.0000000000000006e-45  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1041  FolC bifunctional protein  33.01 
 
 
451 aa  183  6e-45  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3277  FolC bifunctional protein  35.63 
 
 
424 aa  183  6e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0897  FolC bifunctional protein  38.69 
 
 
424 aa  182  1e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.54283e-31 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3348  FolC bifunctional protein  37.47 
 
 
424 aa  182  1e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3147  FolC bifunctional protein  37.47 
 
 
817 aa  181  2e-44  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0120997  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0782  FolC bifunctional protein  30.95 
 
 
435 aa  180  4.999999999999999e-44  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0759  FolC bifunctional protein  30.95 
 
 
437 aa  179  7e-44  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2780  FolC bifunctional protein  33.96 
 
 
437 aa  177  2e-43  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.38262  normal  0.709673 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2872  FolC bifunctional protein  39.32 
 
 
458 aa  177  3e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.660118  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0533  FolC bifunctional protein  34.53 
 
 
440 aa  177  3e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.861672 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2397  FolC bifunctional protein  37.25 
 
 
452 aa  176  6e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0236925  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1568  FolC bifunctional protein  28.74 
 
 
432 aa  176  7e-43  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0949  FolC bifunctional protein  34.13 
 
 
433 aa  175  9.999999999999999e-43  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3562  FolC bifunctional protein  42.27 
 
 
467 aa  174  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.523756  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3557  FolC bifunctional protein  42.54 
 
 
467 aa  175  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.011361  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3630  FolC bifunctional protein  42.54 
 
 
467 aa  175  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.299484 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0467  FolC bifunctional protein  33.95 
 
 
434 aa  174  1.9999999999999998e-42  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000374021  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1472  FolC bifunctional protein  40 
 
 
425 aa  174  2.9999999999999996e-42  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0335611  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4360  FolC bifunctional protein  31.07 
 
 
459 aa  173  3.9999999999999995e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0016  folylpolyglutamate synthetase  32.77 
 
 
439 aa  172  7.999999999999999e-42  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0119  FolC bifunctional protein  31.52 
 
 
447 aa  172  7.999999999999999e-42  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.205687 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1384  FolC bifunctional protein  28.01 
 
 
428 aa  172  7.999999999999999e-42  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1469  FolC bifunctional protein  35.97 
 
 
471 aa  170  5e-41  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0493364  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0591  FolC bifunctional protein  32.06 
 
 
474 aa  170  5e-41  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1218  folylpolyglutamate synthase  30.46 
 
 
419 aa  169  6e-41  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.672843  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0015  FolC bifunctional protein  30.88 
 
 
438 aa  169  1e-40  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.124008  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1166  FolC bifunctional protein  29.95 
 
 
428 aa  167  5e-40  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1051  FolC bifunctional protein  29.51 
 
 
425 aa  167  5e-40  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0075  FolC bifunctional protein  34.53 
 
 
442 aa  166  5.9999999999999996e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0673465  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0295  FolC bifunctional protein  36.95 
 
 
426 aa  166  9e-40  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0510  FolC bifunctional protein  33.72 
 
 
437 aa  166  9e-40  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_15  folylpolyglutamate synthetase  32.77 
 
 
437 aa  165  1.0000000000000001e-39  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0344  FolC bifunctional protein  28.54 
 
 
435 aa  165  1.0000000000000001e-39  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3950  FolC bifunctional protein  42 
 
 
471 aa  165  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.789566  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1549  FolC bifunctional protein  28.47 
 
 
422 aa  164  2.0000000000000002e-39  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1404  FolC bifunctional protein  31.57 
 
 
438 aa  165  2.0000000000000002e-39  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.327079 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4359  FolC bifunctional protein  31.09 
 
 
427 aa  164  3e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.601802  normal  0.624925 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3099  FolC bifunctional protein  35.2 
 
 
438 aa  164  3e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0059  FolC bifunctional protein  35.66 
 
 
421 aa  162  7e-39  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.873383  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0880  FolC bifunctional protein  29.06 
 
 
431 aa  163  7e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01530  folylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  32.37 
 
 
466 aa  162  8.000000000000001e-39  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.0193239 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4713  dihydropteroate synthase  34.07 
 
 
810 aa  162  1e-38  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.464706  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4541  FolC bifunctional protein  33.18 
 
 
453 aa  162  1e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.195738  normal  0.774158 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0351  FolC bifunctional protein  35.71 
 
 
414 aa  162  1e-38  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.651098 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1110  FolC bifunctional protein  27.21 
 
 
465 aa  162  1e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.94602 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2554  dihydropteroate synthase  35.01 
 
 
840 aa  162  1e-38  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.324611  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3284  dihydropteroate synthase  34.7 
 
 
847 aa  161  2e-38  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0738  folylpolyglutamate synthetase; dihydrofolate synthetase  34.16 
 
 
422 aa  161  2e-38  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00754435  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0455  folylpolyglutamate synthase  31.67 
 
 
393 aa  161  2e-38  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1468  bifunctional folylpolyglutamate synthase/ dihydrofolate synthase  34.11 
 
 
422 aa  160  3e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2572  FolC bifunctional protein  28.09 
 
 
431 aa  161  3e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3070  FolC bifunctional protein  29.02 
 
 
428 aa  159  7e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0087  FolC bifunctional protein  32.88 
 
 
454 aa  159  9e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0279686 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2631  FolC bifunctional protein  41.01 
 
 
471 aa  159  1e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0121718  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>