More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_3950 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009077  Mjls_3562  FolC bifunctional protein  85.74 
 
 
467 aa  712    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.523756  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12473  folylpolyglutamate synthase protein folC  77.87 
 
 
487 aa  694    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.669208 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3557  FolC bifunctional protein  85.53 
 
 
467 aa  711    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.011361  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3630  FolC bifunctional protein  85.53 
 
 
467 aa  711    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.299484 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3950  FolC bifunctional protein  100 
 
 
471 aa  931    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.789566  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2631  FolC bifunctional protein  90.66 
 
 
471 aa  760    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0121718  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2054  FolC bifunctional protein  68.47 
 
 
508 aa  608  1e-173  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.832058  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1469  FolC bifunctional protein  68.8 
 
 
471 aa  596  1e-169  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0493364  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1166  FolC bifunctional protein  60.55 
 
 
452 aa  512  1e-144  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.343564  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12370  folylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  59.61 
 
 
470 aa  508  1e-143  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.867028  normal  0.34816 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1496  FolC bifunctional protein  58.24 
 
 
515 aa  463  1e-129  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.038753  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1582  FolC bifunctional protein  57.14 
 
 
447 aa  450  1e-125  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3871  FolC bifunctional protein  55.76 
 
 
444 aa  428  1e-118  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000822129 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3492  FolC bifunctional protein  55.3 
 
 
444 aa  422  1e-117  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.371874 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3470  FolC bifunctional protein  54.42 
 
 
460 aa  420  1e-116  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.00143451  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7289  FolC bifunctional protein  53.83 
 
 
515 aa  403  1e-111  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1456  FolC bifunctional protein  51.69 
 
 
461 aa  399  9.999999999999999e-111  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.363059  normal  0.651546 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23910  folylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  48.92 
 
 
466 aa  392  1e-108  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.290984  normal  0.331564 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1536  FolC bifunctional protein  49.46 
 
 
471 aa  390  1e-107  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00142339  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09160  folylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  47.35 
 
 
464 aa  387  1e-106  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.2219 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2190  folylpolyglutamate synthetase  53.69 
 
 
443 aa  383  1e-105  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.400499  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7286  FolC bifunctional protein  53.11 
 
 
440 aa  381  1e-104  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0401599  normal  0.82683 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0742  FolC bifunctional protein  51.43 
 
 
445 aa  381  1e-104  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0127305  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0971  FolC bifunctional protein  46.71 
 
 
463 aa  377  1e-103  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.764071  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5271  FolC bifunctional protein  51.19 
 
 
468 aa  375  1e-103  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.73776  normal  0.0925623 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2567  FolC bifunctional protein  49.47 
 
 
477 aa  370  1e-101  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0405628 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1149  FolC bifunctional protein  48.03 
 
 
468 aa  371  1e-101  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.498576  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3497  FolC bifunctional protein  51.24 
 
 
526 aa  366  1e-100  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09900  folylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  48.68 
 
 
462 aa  365  1e-100  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.175662  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3391  FolC bifunctional protein  51.58 
 
 
450 aa  363  4e-99  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1159  FolC bifunctional protein  52.55 
 
 
448 aa  356  5e-97  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.728641  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2151  FolC bifunctional protein  45.25 
 
 
452 aa  344  2e-93  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000358705 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2472  FolC bifunctional protein  52.03 
 
 
448 aa  339  5.9999999999999996e-92  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.829093 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2397  FolC bifunctional protein  46 
 
 
452 aa  326  6e-88  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0236925  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0464  bifunctional protein FolC  42.52 
 
 
485 aa  320  5e-86  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0218  folylpolyglutamate synthase  41.45 
 
 
543 aa  318  2e-85  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.296373  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10060  folylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  46.34 
 
 
517 aa  310  4e-83  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0614785  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0759  FolC bifunctional protein  34.42 
 
 
437 aa  231  3e-59  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0782  FolC bifunctional protein  34.42 
 
 
435 aa  231  3e-59  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0533  FolC bifunctional protein  38.3 
 
 
440 aa  223  6e-57  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.861672 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0758  FolC bifunctional protein  33.26 
 
 
443 aa  220  3e-56  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2209  FolC bifunctional protein  33.1 
 
 
429 aa  211  2e-53  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.791737  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01530  folylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  34.77 
 
 
466 aa  207  2e-52  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.0193239 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1209  folylpolyglutamate synthase-like  41.29 
 
 
476 aa  207  3e-52  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.503356  normal  0.49053 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0295  FolC bifunctional protein  39.95 
 
 
426 aa  206  6e-52  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1208  FolC bifunctional protein  38.39 
 
 
445 aa  206  7e-52  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.482446 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4575  tetrahydrofolylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  30.88 
 
 
433 aa  205  1e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.095656  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4548  folylpolyglutamate synthase  30.88 
 
 
433 aa  205  2e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0880  FolC bifunctional protein  34.96 
 
 
431 aa  204  3e-51  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0016  folylpolyglutamate synthetase  35.91 
 
 
439 aa  203  5e-51  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1671  FolC bifunctional protein  37.35 
 
 
431 aa  203  6e-51  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.239696  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4354  folylpolyglutamate synthase  30.64 
 
 
433 aa  202  8e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4190  folylpolyglutamate synthase  30.64 
 
 
433 aa  202  8e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4689  folylpolyglutamate synthase  30.64 
 
 
433 aa  202  8e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4201  folylpolyglutamate synthase  30.64 
 
 
433 aa  202  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4544  tetrahydrofolylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  30.64 
 
 
433 aa  202  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4590  tetrahydrofolylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  30.64 
 
 
433 aa  202  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0659  tetrahydrofolylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  30.64 
 
 
433 aa  200  5e-50  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1456  FolC bifunctional protein  35.11 
 
 
438 aa  198  2.0000000000000003e-49  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0467  FolC bifunctional protein  32.89 
 
 
434 aa  197  3e-49  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000374021  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3345  FolC bifunctional protein  34.71 
 
 
429 aa  197  5.000000000000001e-49  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.63219  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4360  FolC bifunctional protein  34.64 
 
 
459 aa  196  5.000000000000001e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2572  FolC bifunctional protein  33.06 
 
 
431 aa  196  7e-49  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3173  FolC bifunctional protein  32.18 
 
 
433 aa  196  8.000000000000001e-49  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1472  FolC bifunctional protein  40.61 
 
 
425 aa  196  8.000000000000001e-49  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0335611  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_15  folylpolyglutamate synthetase  34.1 
 
 
437 aa  196  1e-48  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0603  FolC bifunctional protein  30.72 
 
 
435 aa  196  1e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3277  FolC bifunctional protein  36.38 
 
 
424 aa  195  2e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4302  FolC bifunctional protein  29.98 
 
 
433 aa  195  2e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0015  FolC bifunctional protein  35.15 
 
 
438 aa  193  5e-48  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.124008  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2174  FolC bifunctional protein  32.18 
 
 
441 aa  192  1e-47  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2552  FolC bifunctional protein  35.27 
 
 
431 aa  191  2e-47  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0970266  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1885  FolC bifunctional protein  31.15 
 
 
441 aa  191  2e-47  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1110  FolC bifunctional protein  28.79 
 
 
465 aa  191  2.9999999999999997e-47  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.94602 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1447  FolC bifunctional protein  33.75 
 
 
424 aa  190  5.999999999999999e-47  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0510  FolC bifunctional protein  35.34 
 
 
437 aa  189  8e-47  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1384  FolC bifunctional protein  33.25 
 
 
428 aa  189  1e-46  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1490  FolC bifunctional protein  31.12 
 
 
432 aa  188  2e-46  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1648  hypothetical protein  35.31 
 
 
416 aa  188  2e-46  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2475  folylpolyglutamate synthetase  35.86 
 
 
424 aa  187  3e-46  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0949  FolC bifunctional protein  33.63 
 
 
433 aa  186  7e-46  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3348  FolC bifunctional protein  38.55 
 
 
424 aa  185  2.0000000000000003e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14370  Folylpolyglutamate synthase  32.03 
 
 
457 aa  184  3e-45  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000137038  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0738  folylpolyglutamate synthetase; dihydrofolate synthetase  37.78 
 
 
422 aa  184  3e-45  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00754435  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2872  FolC bifunctional protein  40.37 
 
 
458 aa  184  3e-45  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.660118  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1278  folylpolyglutamate synthase  32.9 
 
 
427 aa  184  4.0000000000000006e-45  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0897  FolC bifunctional protein  39.9 
 
 
424 aa  182  8.000000000000001e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.54283e-31 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1821  FolC bifunctional protein  42 
 
 
428 aa  182  1e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.505813 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1166  FolC bifunctional protein  31.35 
 
 
428 aa  179  1e-43  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0602  dihydropteroate synthase  34.47 
 
 
813 aa  177  2e-43  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0325  dihydropteroate synthase  33.91 
 
 
878 aa  177  4e-43  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.899871  normal  0.0161218 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1568  FolC bifunctional protein  30.89 
 
 
432 aa  176  6e-43  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4541  FolC bifunctional protein  34.75 
 
 
453 aa  176  7e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.195738  normal  0.774158 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1048  FolC bifunctional protein  32.53 
 
 
433 aa  176  9.999999999999999e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.252372 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0775  FolC bifunctional protein  34.31 
 
 
441 aa  174  1.9999999999999998e-42  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00183365  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1996  FolC bifunctional protein  34.51 
 
 
428 aa  173  5e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0734572  normal  0.0222652 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0325  FolC bifunctional protein  34.22 
 
 
438 aa  173  5.999999999999999e-42  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1041  FolC bifunctional protein  30.95 
 
 
451 aa  173  6.999999999999999e-42  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1046  FolC bifunctional protein  34.66 
 
 
411 aa  173  6.999999999999999e-42  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.777875 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0119  FolC bifunctional protein  32.56 
 
 
447 aa  172  1e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.205687 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>