More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_1469 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014158  Tpau_1469  FolC bifunctional protein  100 
 
 
471 aa  933    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0493364  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2054  FolC bifunctional protein  67.75 
 
 
508 aa  612  9.999999999999999e-175  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.832058  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12473  folylpolyglutamate synthase protein folC  66.95 
 
 
487 aa  588  1e-166  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.669208 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2631  FolC bifunctional protein  69.98 
 
 
471 aa  573  1.0000000000000001e-162  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0121718  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3950  FolC bifunctional protein  68.59 
 
 
471 aa  573  1.0000000000000001e-162  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.789566  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3562  FolC bifunctional protein  68.4 
 
 
467 aa  557  1e-157  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.523756  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3557  FolC bifunctional protein  68.18 
 
 
467 aa  556  1e-157  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.011361  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3630  FolC bifunctional protein  68.18 
 
 
467 aa  556  1e-157  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.299484 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12370  folylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  62.28 
 
 
470 aa  551  1e-156  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.867028  normal  0.34816 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1166  FolC bifunctional protein  62.63 
 
 
452 aa  548  1e-155  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.343564  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1496  FolC bifunctional protein  60 
 
 
515 aa  496  1e-139  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.038753  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1582  FolC bifunctional protein  58.24 
 
 
447 aa  484  1e-135  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3492  FolC bifunctional protein  56.24 
 
 
444 aa  444  1e-123  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.371874 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3871  FolC bifunctional protein  55.95 
 
 
444 aa  436  1e-121  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000822129 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3470  FolC bifunctional protein  54.67 
 
 
460 aa  427  1e-118  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.00143451  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5271  FolC bifunctional protein  54.25 
 
 
468 aa  408  1e-113  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.73776  normal  0.0925623 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7286  FolC bifunctional protein  53.76 
 
 
440 aa  408  1e-113  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0401599  normal  0.82683 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0971  FolC bifunctional protein  50.22 
 
 
463 aa  408  1.0000000000000001e-112  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.764071  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23910  folylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  50 
 
 
466 aa  403  1e-111  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.290984  normal  0.331564 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7289  FolC bifunctional protein  52.38 
 
 
515 aa  405  1e-111  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1536  FolC bifunctional protein  49.28 
 
 
471 aa  404  1e-111  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00142339  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1456  FolC bifunctional protein  51.24 
 
 
461 aa  399  9.999999999999999e-111  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.363059  normal  0.651546 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0742  FolC bifunctional protein  54.75 
 
 
445 aa  396  1e-109  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0127305  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09160  folylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  47.78 
 
 
464 aa  391  1e-107  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.2219 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2567  FolC bifunctional protein  50.86 
 
 
477 aa  389  1e-107  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0405628 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3391  FolC bifunctional protein  51.44 
 
 
450 aa  387  1e-106  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2190  folylpolyglutamate synthetase  52.54 
 
 
443 aa  383  1e-105  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.400499  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1149  FolC bifunctional protein  48.79 
 
 
468 aa  381  1e-104  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.498576  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3497  FolC bifunctional protein  49.25 
 
 
526 aa  377  1e-103  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2472  FolC bifunctional protein  55.37 
 
 
448 aa  367  1e-100  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.829093 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09900  folylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  47.14 
 
 
462 aa  359  5e-98  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.175662  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1159  FolC bifunctional protein  49.77 
 
 
448 aa  359  6e-98  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.728641  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2151  FolC bifunctional protein  47.25 
 
 
452 aa  354  2e-96  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000358705 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2397  FolC bifunctional protein  47.91 
 
 
452 aa  350  3e-95  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0236925  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0218  folylpolyglutamate synthase  41.98 
 
 
543 aa  327  2.0000000000000001e-88  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.296373  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0464  bifunctional protein FolC  43.48 
 
 
485 aa  327  2.0000000000000001e-88  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10060  folylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  46.46 
 
 
517 aa  318  2e-85  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0614785  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0758  FolC bifunctional protein  34.65 
 
 
443 aa  232  1e-59  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1209  folylpolyglutamate synthase-like  41.06 
 
 
476 aa  230  3e-59  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.503356  normal  0.49053 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0782  FolC bifunctional protein  32.31 
 
 
435 aa  221  3e-56  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0759  FolC bifunctional protein  32.31 
 
 
437 aa  221  3e-56  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1671  FolC bifunctional protein  35.99 
 
 
431 aa  214  2.9999999999999995e-54  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.239696  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4548  folylpolyglutamate synthase  30.69 
 
 
433 aa  213  7e-54  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01530  folylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  33.79 
 
 
466 aa  212  1e-53  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.0193239 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0880  FolC bifunctional protein  33.11 
 
 
431 aa  211  2e-53  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0533  FolC bifunctional protein  36.16 
 
 
440 aa  211  2e-53  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.861672 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1456  FolC bifunctional protein  34.14 
 
 
438 aa  211  3e-53  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3345  FolC bifunctional protein  35.19 
 
 
429 aa  210  4e-53  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.63219  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4590  tetrahydrofolylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  30.69 
 
 
433 aa  210  5e-53  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4201  folylpolyglutamate synthase  30.45 
 
 
433 aa  209  6e-53  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2552  FolC bifunctional protein  36.26 
 
 
431 aa  209  8e-53  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0970266  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4544  tetrahydrofolylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  30.45 
 
 
433 aa  209  1e-52  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4354  folylpolyglutamate synthase  30.45 
 
 
433 aa  209  1e-52  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4190  folylpolyglutamate synthase  30.45 
 
 
433 aa  209  1e-52  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4689  folylpolyglutamate synthase  30.45 
 
 
433 aa  209  1e-52  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1208  FolC bifunctional protein  36.53 
 
 
445 aa  208  1e-52  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.482446 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0467  FolC bifunctional protein  35.16 
 
 
434 aa  206  1e-51  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000374021  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0295  FolC bifunctional protein  36.51 
 
 
426 aa  205  1e-51  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4575  tetrahydrofolylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  29.46 
 
 
433 aa  205  1e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.095656  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4360  FolC bifunctional protein  33.49 
 
 
459 aa  205  1e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1447  FolC bifunctional protein  33.99 
 
 
424 aa  204  3e-51  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4302  FolC bifunctional protein  29.66 
 
 
433 aa  204  3e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3277  FolC bifunctional protein  35.54 
 
 
424 aa  201  3e-50  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0659  tetrahydrofolylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  29.21 
 
 
433 aa  201  3e-50  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2209  FolC bifunctional protein  33.11 
 
 
429 aa  200  3.9999999999999996e-50  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.791737  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3173  FolC bifunctional protein  31.66 
 
 
433 aa  200  5e-50  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2475  folylpolyglutamate synthetase  36.72 
 
 
424 aa  199  7.999999999999999e-50  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0016  folylpolyglutamate synthetase  34.85 
 
 
439 aa  196  6e-49  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2572  FolC bifunctional protein  32.28 
 
 
431 aa  196  8.000000000000001e-49  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1051  FolC bifunctional protein  33.26 
 
 
425 aa  195  1e-48  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1472  FolC bifunctional protein  39.79 
 
 
425 aa  192  1e-47  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0335611  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2780  FolC bifunctional protein  36.45 
 
 
437 aa  191  2e-47  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.38262  normal  0.709673 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1384  FolC bifunctional protein  31.19 
 
 
428 aa  191  2e-47  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0510  FolC bifunctional protein  33.7 
 
 
437 aa  191  2.9999999999999997e-47  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1278  folylpolyglutamate synthase  30.22 
 
 
427 aa  190  4e-47  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1110  FolC bifunctional protein  31.89 
 
 
465 aa  189  7e-47  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.94602 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0325  dihydropteroate synthase  34.73 
 
 
878 aa  189  1e-46  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.899871  normal  0.0161218 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1041  FolC bifunctional protein  30.37 
 
 
451 aa  189  1e-46  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1648  hypothetical protein  30.48 
 
 
416 aa  187  2e-46  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0015  FolC bifunctional protein  33.86 
 
 
438 aa  187  3e-46  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.124008  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0738  folylpolyglutamate synthetase; dihydrofolate synthetase  35.24 
 
 
422 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00754435  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2174  FolC bifunctional protein  32.11 
 
 
441 aa  184  3e-45  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_15  folylpolyglutamate synthetase  32.41 
 
 
437 aa  184  4.0000000000000006e-45  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1830  FolC bifunctional protein  33.86 
 
 
432 aa  184  4.0000000000000006e-45  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0684286  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1885  FolC bifunctional protein  31.26 
 
 
441 aa  184  4.0000000000000006e-45  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4541  FolC bifunctional protein  33.63 
 
 
453 aa  183  5.0000000000000004e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.195738  normal  0.774158 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0351  FolC bifunctional protein  35.37 
 
 
414 aa  183  5.0000000000000004e-45  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.651098 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1821  FolC bifunctional protein  35.97 
 
 
428 aa  183  7e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.505813 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1996  FolC bifunctional protein  33.87 
 
 
428 aa  182  9.000000000000001e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0734572  normal  0.0222652 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0949  FolC bifunctional protein  32.73 
 
 
433 aa  182  9.000000000000001e-45  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3348  FolC bifunctional protein  35.02 
 
 
424 aa  181  2.9999999999999997e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1568  FolC bifunctional protein  29.16 
 
 
432 aa  179  7e-44  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1490  FolC bifunctional protein  30.93 
 
 
432 aa  179  8e-44  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2308  FolC bifunctional protein  34.96 
 
 
442 aa  179  9e-44  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.000000091683  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1510  FolC bifunctional protein  28.29 
 
 
413 aa  179  9e-44  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0603  FolC bifunctional protein  29.46 
 
 
435 aa  179  9e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2653  FolC bifunctional protein  35.62 
 
 
422 aa  179  1e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.768259  normal  0.357949 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07720  folylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  34.81 
 
 
427 aa  179  1e-43  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.278263 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0897  FolC bifunctional protein  36.9 
 
 
424 aa  178  2e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.54283e-31 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1048  FolC bifunctional protein  33.17 
 
 
433 aa  177  3e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.252372 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>