More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_3959 on replicon NC_009620
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009620  Smed_3959  inositol-phosphate phosphatase  100 
 
 		 318 aa  642    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5572  inositol-phosphate phosphatase  48.73 
 
 		 267 aa  190  2.9999999999999997e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.963489 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04390  inositol monophosphatase/fructose-1,6-bisphosphatase family protein  43.6 
 
 		 301 aa  172  7.999999999999999e-42  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.441923  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13150  inositol monophosphatase/fructose-1,6-bisphosphatase family protein  37.08 
 
 		 299 aa  138  1e-31  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.534591  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1619  inositol-1(or 4)-monophosphatase  36.89 
 
 		 267 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.28291 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2518  Inositol-phosphate phosphatase  37.08 
 
 		 267 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0217752  hitchhiker  0.00000560671 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2060  inositol-1(or 4)-monophosphatase  37.56 
 
 		 282 aa  132  1.0000000000000001e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.855853 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1028  inositol monophosphatase  34.35 
 
 		 269 aa  129  8.000000000000001e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00157763  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2689  inositol-1-monophosphatase  40.31 
 
 		 320 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0179732  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1934  inositol-1-monophosphatase  40.31 
 
 		 363 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.141779  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1664  inositol-1-monophosphatase  40.31 
 
 		 267 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0475156  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1441  inositol-1-monophosphatase  40.31 
 
 		 267 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.115628  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2605  inositol monophosphatase family protein  40.31 
 
 		 267 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2553  inositol monophosphatase family protein  40.31 
 
 		 267 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4652  inositol-phosphate phosphatase  39.15 
 
 		 283 aa  127  2.0000000000000002e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.794798  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2168  inositol-1-monophosphatase  40.31 
 
 		 267 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.289149  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3149  inositol-1-monophosphatase  40.31 
 
 		 267 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.231747  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2439  inositol-1-monophosphatase  38.03 
 
 		 315 aa  124  2e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1397  inositol-phosphate phosphatase  35.42 
 
 		 267 aa  124  2e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.500053  hitchhiker  0.000599171 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2321  inositol monophosphatase  36.32 
 
 		 267 aa  124  3e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000655872  normal  0.931835 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40440  Inositol-1-monophosphatase  37.12 
 
 		 268 aa  123  3e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.443027  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1772  inositol-phosphate phosphatase  34.27 
 
 		 283 aa  123  4e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.32038  hitchhiker  0.00184964 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0004  inositol-phosphate phosphatase  37.27 
 
 		 260 aa  123  4e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2875  inositol-phosphate phosphatase  32.71 
 
 		 267 aa  122  8e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000220191 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7280  inositol monophosphatase  34.1 
 
 		 264 aa  122  8e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0255139  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14680  extragenic suppressor protein SuhB  36.33 
 
 		 271 aa  122  9e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6007  inositol-phosphate phosphatase  35.94 
 
 		 264 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00601575 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4616  inositol monophosphatase  38.26 
 
 		 272 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00318187  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1295  extragenic suppressor protein SuhB  35.92 
 
 		 271 aa  120  3e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3515  inositol-phosphate phosphatase  36.68 
 
 		 271 aa  120  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.588619 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2153  inositol-phosphate phosphatase  34.33 
 
 		 267 aa  119  4.9999999999999996e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.38913  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2428  inositol monophosphatase  35.14 
 
 		 267 aa  119  7e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.857801  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4997  Inositol-phosphate phosphatase  33.05 
 
 		 264 aa  119  7.999999999999999e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000132366  normal  0.733856 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0818  Inositol-phosphate phosphatase  39.3 
 
 		 267 aa  119  9e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0219186  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0669  inositol monophosphate family protein  39.3 
 
 		 267 aa  119  9e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1419  inositol-1-monophosphatase  37.55 
 
 		 271 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.57884  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0128  inositol monophosphatase  38.42 
 
 		 258 aa  118  9.999999999999999e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1233  inositol monophosphatase  37.99 
 
 		 271 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.901192  normal  0.728065 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0412  inositol-phosphate phosphatase  34.06 
 
 		 276 aa  118  9.999999999999999e-26  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0164618 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2260  extragenic suppressor protein SuhB  35.57 
 
 		 267 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1454  inositol monophosphatase  35.02 
 
 		 267 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00259546  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1534  inositol monophosphatase  37.55 
 
 		 258 aa  117  1.9999999999999998e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0685889  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1735  inositol-phosphate phosphatase  34.92 
 
 		 267 aa  118  1.9999999999999998e-25  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000203014  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0078  inositol-phosphate phosphatase  36.53 
 
 		 270 aa  118  1.9999999999999998e-25  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.105293 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2284  inositol monophosphatase  34.92 
 
 		 267 aa  118  1.9999999999999998e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00357051  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2598  inositol monophosphatase  35.75 
 
 		 309 aa  118  1.9999999999999998e-25  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.624255  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2506  inositol-phosphate phosphatase  35.59 
 
 		 267 aa  117  3e-25  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.024533  normal  0.0296693 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1681  inositol monophosphatase  37.31 
 
 		 268 aa  117  3e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1957  Inositol-phosphate phosphatase  35.59 
 
 		 267 aa  117  3e-25  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000619286  normal  0.0182477 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2401  inositol-phosphate phosphatase  35.59 
 
 		 267 aa  117  3e-25  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0002318  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1289  extragenic suppressor protein SuhB  34.23 
 
 		 267 aa  117  3e-25  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.077456  normal  0.0155379 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2390  inositol-phosphate phosphatase  35.59 
 
 		 267 aa  117  3e-25  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000252035  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1815  inositol-phosphate phosphatase  36.21 
 
 		 267 aa  116  3.9999999999999997e-25  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00063204  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1321  inositol-phosphate phosphatase  34.25 
 
 		 262 aa  116  6e-25  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0218475  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2841  inositol-1(or 4)-monophosphatase  36.27 
 
 		 330 aa  116  6e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.202978  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1510  inositol monophosphatase  38.28 
 
 		 266 aa  116  6e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2747  Inositol-phosphate phosphatase  37.25 
 
 		 275 aa  115  6.9999999999999995e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.436852  normal  0.572242 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1244  inositol-phosphate phosphatase  34.06 
 
 		 266 aa  115  6.9999999999999995e-25  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1796  inositol-phosphate phosphatase  37.5 
 
 		 269 aa  116  6.9999999999999995e-25  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3293  inositol-1(or 4)-monophosphatase  36 
 
 		 328 aa  115  7.999999999999999e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.657669  normal  0.273671 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01351  inositol-1-monophosphatase  33.88 
 
 		 255 aa  115  8.999999999999998e-25  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.104947  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1160  inositol monophosphatase  38.46 
 
 		 270 aa  115  1.0000000000000001e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.728684  normal  0.192207 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3707  Inositol-phosphate phosphatase  35.43 
 
 		 272 aa  115  1.0000000000000001e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000252692  hitchhiker  0.000000465281 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2908  inositol monophosphatase  35.62 
 
 		 267 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.000930444  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1380  inositol-phosphate phosphatase  36.6 
 
 		 330 aa  115  1.0000000000000001e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.135454  hitchhiker  0.00587687 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0802  Inositol-phosphate phosphatase  33.33 
 
 		 257 aa  114  2.0000000000000002e-24  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0983  inositol monophosphatase  34.48 
 
 		 270 aa  114  2.0000000000000002e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000000133675  normal  0.845013 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2070  inositol monophosphatase  36.36 
 
 		 313 aa  114  2.0000000000000002e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.662366  normal  0.672639 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4248  inositol-phosphate phosphatase  36.36 
 
 		 297 aa  114  2.0000000000000002e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0646891  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2746  inositol monophosphatase  35.16 
 
 		 267 aa  114  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.139672  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02425  inositol monophosphatase  35.16 
 
 		 267 aa  114  3e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.648235  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1135  Inositol-phosphate phosphatase  35.16 
 
 		 267 aa  114  3e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.915199  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02389  hypothetical protein  35.16 
 
 		 267 aa  114  3e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.516636  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2685  inositol monophosphatase  35.16 
 
 		 267 aa  114  3e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000252767  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3765  inositol monophosphatase  35.16 
 
 		 267 aa  114  3e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0228752  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1144  inositol monophosphatase  35.16 
 
 		 267 aa  114  3e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.221581  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2818  inositol monophosphatase  35.16 
 
 		 267 aa  114  3e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000612182  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3034  inositol monophosphatase  37.31 
 
 		 267 aa  114  3e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.251178  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2686  inositol monophosphatase  35.16 
 
 		 267 aa  114  3e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.10987  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2787  inositol monophosphatase  35.16 
 
 		 267 aa  113  4.0000000000000004e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.0013173  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3679  inositol-phosphate phosphatase  37.1 
 
 		 240 aa  113  4.0000000000000004e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2701  inositol monophosphatase  35.16 
 
 		 267 aa  113  5e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000859824  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2921  inositol monophosphatase  35.16 
 
 		 267 aa  113  5e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0208321  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0672  inositol-1(or 4)-monophosphatase  36.79 
 
 		 273 aa  113  5e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.000135062  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2282  inositol monophosphatase  36.04 
 
 		 266 aa  113  5e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.476526  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2706  inositol monophosphatase  37.5 
 
 		 266 aa  113  5e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000310915 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2808  inositol monophosphatase  35.16 
 
 		 267 aa  113  5e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0630411  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1218  inositol-phosphate phosphatase  36.6 
 
 		 431 aa  113  6e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1545  inositol-1(or 4)-monophosphatase  39.59 
 
 		 259 aa  112  6e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2186  inositol monophosphatase  33.62 
 
 		 259 aa  112  6e-24  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0881  inositol-phosphate phosphatase  36.52 
 
 		 272 aa  112  7.000000000000001e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0394211 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4340  inositol-phosphate phosphatase  36.52 
 
 		 272 aa  112  7.000000000000001e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.957686  hitchhiker  0.00000000805299 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0838  inositol-phosphate phosphatase  36.09 
 
 		 272 aa  112  8.000000000000001e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.976712  normal  0.859665 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0868  inositol-phosphate phosphatase  36.09 
 
 		 272 aa  112  8.000000000000001e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.409513 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0614  inositol monophosphatase  36.13 
 
 		 266 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000550019  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6775  inositol-1(or 4)-monophosphatase  35.48 
 
 		 264 aa  111  1.0000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0813  inositol monophosphatase  36.27 
 
 		 268 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000261138  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3566  inositol monophosphatase  32.87 
 
 		 353 aa  112  1.0000000000000001e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00388  inositol-1-monophosphatase  37.1 
 
 		 277 aa  112  1.0000000000000001e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.25186  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1036  Inositol-phosphate phosphatase  33.48 
 
 		 269 aa  112  1.0000000000000001e-23  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>