More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_4652 on replicon NC_008688
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008688  Pden_4652  inositol-phosphate phosphatase  100 
 
 
283 aa  570  1e-161  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.794798  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2063  Inositol-phosphate phosphatase  42.86 
 
 
259 aa  137  3.0000000000000003e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.948209  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2875  inositol-phosphate phosphatase  39.91 
 
 
267 aa  134  9.999999999999999e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000220191 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1772  inositol-phosphate phosphatase  39.55 
 
 
283 aa  133  3e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.32038  hitchhiker  0.00184964 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0888  inositol monophosphatase  36.58 
 
 
269 aa  133  3.9999999999999996e-30  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0122019  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2321  inositol monophosphatase  38.14 
 
 
267 aa  133  3.9999999999999996e-30  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000655872  normal  0.931835 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2609  inositol monophosphatase family protein  40.8 
 
 
270 aa  132  5e-30  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1796  inositol-phosphate phosphatase  39.01 
 
 
269 aa  132  7.999999999999999e-30  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1244  inositol-phosphate phosphatase  36.48 
 
 
266 aa  131  1.0000000000000001e-29  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1410  inositol-1(or 4)-monophosphatase  38.07 
 
 
267 aa  130  2.0000000000000002e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3959  inositol-phosphate phosphatase  39.22 
 
 
318 aa  129  4.0000000000000003e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01351  inositol-1-monophosphatase  38.89 
 
 
255 aa  129  5.0000000000000004e-29  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.104947  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1028  inositol monophosphatase  36.56 
 
 
269 aa  129  5.0000000000000004e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00157763  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2746  inositol monophosphatase  41.26 
 
 
267 aa  129  6e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.139672  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2582  myo-inositol-1(or 4)-monophosphatase  37.91 
 
 
273 aa  129  7.000000000000001e-29  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3030  inositol monophosphatase  39.82 
 
 
268 aa  129  7.000000000000001e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0983926  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2935  inositol monophosphatase  35.51 
 
 
263 aa  129  7.000000000000001e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.932789  normal  0.110329 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0983  inositol monophosphatase  40.17 
 
 
270 aa  128  9.000000000000001e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000000133675  normal  0.845013 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2787  inositol monophosphatase  40.71 
 
 
267 aa  128  9.000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.0013173  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02425  inositol monophosphatase  40.71 
 
 
267 aa  128  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.648235  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1135  Inositol-phosphate phosphatase  40.71 
 
 
267 aa  128  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.915199  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1144  inositol monophosphatase  40.71 
 
 
267 aa  128  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.221581  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02389  hypothetical protein  40.71 
 
 
267 aa  128  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.516636  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2818  inositol monophosphatase  40.71 
 
 
267 aa  128  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000612182  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2686  inositol monophosphatase  40.71 
 
 
267 aa  128  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.10987  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3765  inositol monophosphatase  40.71 
 
 
267 aa  128  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0228752  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2101  inositol-phosphate phosphatase  40.45 
 
 
267 aa  128  1.0000000000000001e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0413503  hitchhiker  0.00162908 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2685  inositol monophosphatase  40.71 
 
 
267 aa  128  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000252767  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1419  inositol-1-monophosphatase  39.64 
 
 
271 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.57884  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2701  inositol monophosphatase  40.27 
 
 
267 aa  127  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000859824  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2908  inositol monophosphatase  40.71 
 
 
267 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.000930444  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2921  inositol monophosphatase  40.27 
 
 
267 aa  127  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0208321  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5572  inositol-phosphate phosphatase  45.05 
 
 
267 aa  127  2.0000000000000002e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.963489 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0078  inositol-phosphate phosphatase  39.65 
 
 
270 aa  127  2.0000000000000002e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.105293 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0543  inositol-phosphate phosphatase  36.48 
 
 
263 aa  127  2.0000000000000002e-28  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2808  inositol monophosphatase  40.27 
 
 
267 aa  127  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0630411  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6007  inositol-phosphate phosphatase  40.58 
 
 
264 aa  127  3e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00601575 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1232  inositol-1(or 4)-monophosphatase  42.62 
 
 
259 aa  126  3e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.223718  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1554  inositol monophosphatase  40.5 
 
 
269 aa  126  3e-28  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.475053  normal  0.933362 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2260  extragenic suppressor protein SuhB  38.22 
 
 
267 aa  126  4.0000000000000003e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0333  inositol-phosphate phosphatase  40.54 
 
 
267 aa  126  4.0000000000000003e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.366405  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0018  inositol monophosphatase  37.95 
 
 
266 aa  126  4.0000000000000003e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000389361  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3034  inositol monophosphatase  40.27 
 
 
267 aa  126  5e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.251178  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1233  inositol monophosphatase  39.72 
 
 
271 aa  125  7e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.901192  normal  0.728065 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1534  inositol monophosphatase  38.1 
 
 
258 aa  125  8.000000000000001e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0685889  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2588  inositol-phosphate phosphatase  39.63 
 
 
265 aa  125  8.000000000000001e-28  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4340  inositol-phosphate phosphatase  38.64 
 
 
272 aa  125  9e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.957686  hitchhiker  0.00000000805299 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1241  inositol monophosphatase  40.81 
 
 
267 aa  125  9e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.921359  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1101  inositol monophosphatase  40.09 
 
 
267 aa  125  9e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0220453  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2153  inositol-phosphate phosphatase  37.05 
 
 
267 aa  125  9e-28  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.38913  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1289  extragenic suppressor protein SuhB  36.61 
 
 
267 aa  125  9e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.077456  normal  0.0155379 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0500  Inositol-phosphate phosphatase  36.89 
 
 
261 aa  125  1e-27  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_18323  predicted protein  36.23 
 
 
288 aa  125  1e-27  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2186  inositol monophosphatase  40.54 
 
 
259 aa  124  1e-27  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0838  inositol-phosphate phosphatase  39.37 
 
 
272 aa  124  2e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.976712  normal  0.859665 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0868  inositol-phosphate phosphatase  39.37 
 
 
272 aa  124  2e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.409513 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2439  inositol-1-monophosphatase  38.25 
 
 
315 aa  124  2e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2747  Inositol-phosphate phosphatase  38.49 
 
 
275 aa  124  2e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.436852  normal  0.572242 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3449  inositol-phosphate phosphatase  39.13 
 
 
301 aa  124  2e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0895511  normal  0.493047 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0412  inositol-phosphate phosphatase  38.27 
 
 
276 aa  124  2e-27  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0164618 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1510  inositol monophosphatase  37.55 
 
 
266 aa  124  2e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0128  inositol monophosphatase  38.31 
 
 
258 aa  124  2e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0278  inositol-1(or 4)-monophosphatase  37.32 
 
 
268 aa  124  2e-27  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2282  inositol monophosphatase  36.71 
 
 
266 aa  124  2e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.476526  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0511  Inositol-phosphate phosphatase  36.13 
 
 
272 aa  123  3e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2401  inositol-phosphate phosphatase  36.89 
 
 
267 aa  123  3e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0002318  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2506  inositol-phosphate phosphatase  36.89 
 
 
267 aa  123  3e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.024533  normal  0.0296693 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3470  Inositol-phosphate phosphatase  38.82 
 
 
265 aa  123  3e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.238149  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1957  Inositol-phosphate phosphatase  36.89 
 
 
267 aa  123  3e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000619286  normal  0.0182477 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0719  inositol-1(or 4)-monophosphatase  41.88 
 
 
265 aa  123  3e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000761228  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2390  inositol-phosphate phosphatase  36.89 
 
 
267 aa  123  3e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000252035  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1815  inositol-phosphate phosphatase  37.67 
 
 
267 aa  123  3e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00063204  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3534  Inositol-phosphate phosphatase  38.82 
 
 
265 aa  123  3e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.050039  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1231  myo-inositol-1(or 4)-monophosphatase  37.75 
 
 
263 aa  123  4e-27  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0360912  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1735  inositol-phosphate phosphatase  37.67 
 
 
267 aa  123  4e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000203014  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0881  inositol-phosphate phosphatase  38.91 
 
 
272 aa  123  4e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0394211 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2284  inositol monophosphatase  37.67 
 
 
267 aa  123  4e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00357051  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3316  inositol monophosphatase  38.14 
 
 
262 aa  122  5e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.546431 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4616  inositol monophosphatase  39.07 
 
 
272 aa  122  5e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00318187  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1295  extragenic suppressor protein SuhB  41.84 
 
 
271 aa  122  5e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1160  inositol monophosphatase  38.05 
 
 
270 aa  122  6e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.728684  normal  0.192207 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7280  inositol monophosphatase  39.32 
 
 
264 aa  122  6e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0255139  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2428  inositol monophosphatase  38.35 
 
 
267 aa  122  6e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.857801  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1280  inositol-1-monophosphatase  37.75 
 
 
266 aa  122  7e-27  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2754  inositol monophosphatase  39.21 
 
 
267 aa  122  8e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00416326  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40440  Inositol-1-monophosphatase  38.32 
 
 
268 aa  121  9.999999999999999e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.443027  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1076  inositol monophosphatase  39.6 
 
 
263 aa  121  9.999999999999999e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0543949  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1698  inositol monophosphatase  38.86 
 
 
261 aa  121  9.999999999999999e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.133457  normal  0.97401 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14680  extragenic suppressor protein SuhB  41.84 
 
 
271 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1165  inositol monophosphatase  37.89 
 
 
267 aa  120  1.9999999999999998e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000142854  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1128  inositol-1-monophosphatase  37.61 
 
 
267 aa  120  1.9999999999999998e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.768163  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0438  inositol monophosphatase  37.89 
 
 
267 aa  120  1.9999999999999998e-26  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0450003  hitchhiker  0.0000301386 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1115  inositol-1(or 4)-monophosphatase  39.38 
 
 
274 aa  121  1.9999999999999998e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2706  inositol monophosphatase  39.11 
 
 
266 aa  121  1.9999999999999998e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000310915 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2324  inositol-phosphate phosphatase  40.38 
 
 
261 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3902  Inositol-phosphate phosphatase  34.84 
 
 
279 aa  120  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.629713  normal  0.634765 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0385  Inositol-phosphate phosphatase  35.86 
 
 
272 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.391446  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1273  inositol monophosphatase  37.89 
 
 
267 aa  120  1.9999999999999998e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000425107  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0561  Inositol-phosphate phosphatase  37.17 
 
 
268 aa  120  3e-26  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0841  inositol monophosphatase  38.97 
 
 
261 aa  120  3e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.800769  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>