More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_0385 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013501  Rmar_0385  Inositol-phosphate phosphatase  100 
 
 
272 aa  550  1e-156  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.391446  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0826  inositol monophosphatase  47.04 
 
 
272 aa  236  4e-61  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.229284 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1078  inositol monophosphatase  45.74 
 
 
273 aa  231  1e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.701332  normal  0.180258 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1772  inositol-phosphate phosphatase  45.17 
 
 
283 aa  228  6e-59  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.32038  hitchhiker  0.00184964 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1218  inositol-phosphate phosphatase  43.3 
 
 
431 aa  225  7e-58  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1289  extragenic suppressor protein SuhB  44.75 
 
 
267 aa  224  2e-57  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.077456  normal  0.0155379 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0818  Inositol-phosphate phosphatase  46.27 
 
 
267 aa  223  3e-57  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0219186  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0669  inositol monophosphate family protein  46.27 
 
 
267 aa  223  3e-57  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2153  inositol-phosphate phosphatase  43.19 
 
 
267 aa  221  9.999999999999999e-57  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.38913  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1115  inositol-1(or 4)-monophosphatase  44.36 
 
 
274 aa  220  1.9999999999999999e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0614  inositol monophosphatase  41.96 
 
 
266 aa  220  1.9999999999999999e-56  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000550019  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2321  inositol monophosphatase  43.24 
 
 
267 aa  220  3e-56  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000655872  normal  0.931835 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1001  Inositol-phosphate phosphatase  42.59 
 
 
270 aa  219  3.9999999999999997e-56  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.165549  normal  0.0783515 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0018  inositol monophosphatase  44.19 
 
 
266 aa  219  3.9999999999999997e-56  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000389361  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1160  inositol monophosphatase  42.8 
 
 
268 aa  219  5e-56  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00412225  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0813  inositol monophosphatase  42.75 
 
 
268 aa  219  5e-56  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000261138  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1957  Inositol-phosphate phosphatase  43.58 
 
 
267 aa  218  6e-56  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000619286  normal  0.0182477 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2401  inositol-phosphate phosphatase  43.58 
 
 
267 aa  218  6e-56  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0002318  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1095  Inositol-phosphate phosphatase  42.59 
 
 
270 aa  218  6e-56  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.47624 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2506  inositol-phosphate phosphatase  43.58 
 
 
267 aa  218  6e-56  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.024533  normal  0.0296693 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2390  inositol-phosphate phosphatase  43.58 
 
 
267 aa  218  6e-56  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000252035  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1231  myo-inositol-1(or 4)-monophosphatase  44.53 
 
 
263 aa  218  7.999999999999999e-56  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0360912  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2875  inositol-phosphate phosphatase  42.47 
 
 
267 aa  218  1e-55  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000220191 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2309  inositol-phosphate phosphatase  47.84 
 
 
304 aa  217  2e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.315096 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1815  inositol-phosphate phosphatase  42.8 
 
 
267 aa  216  2.9999999999999998e-55  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00063204  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2841  inositol-1(or 4)-monophosphatase  42.15 
 
 
330 aa  216  2.9999999999999998e-55  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.202978  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0854  inositol monophosphatase  44.92 
 
 
262 aa  216  4e-55  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1280  inositol-1-monophosphatase  44.14 
 
 
266 aa  215  5e-55  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0672  inositol-1(or 4)-monophosphatase  43.75 
 
 
273 aa  215  5.9999999999999996e-55  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.000135062  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1735  inositol-phosphate phosphatase  42.8 
 
 
267 aa  215  7e-55  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000203014  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2284  inositol monophosphatase  42.8 
 
 
267 aa  215  7e-55  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00357051  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0078  inositol-phosphate phosphatase  47.08 
 
 
270 aa  213  1.9999999999999998e-54  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.105293 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2260  extragenic suppressor protein SuhB  42.8 
 
 
267 aa  213  2.9999999999999995e-54  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1321  inositol-phosphate phosphatase  41.96 
 
 
262 aa  213  3.9999999999999995e-54  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0218475  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4248  inositol-phosphate phosphatase  48.07 
 
 
297 aa  213  3.9999999999999995e-54  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0646891  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2605  inositol monophosphatase family protein  43.3 
 
 
267 aa  212  5.999999999999999e-54  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1441  inositol-1-monophosphatase  43.3 
 
 
267 aa  212  5.999999999999999e-54  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.115628  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1664  inositol-1-monophosphatase  43.3 
 
 
267 aa  212  5.999999999999999e-54  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0475156  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2553  inositol monophosphatase family protein  43.3 
 
 
267 aa  212  5.999999999999999e-54  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3149  inositol-1-monophosphatase  43.3 
 
 
267 aa  212  5.999999999999999e-54  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.231747  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2168  inositol-1-monophosphatase  43.3 
 
 
267 aa  212  5.999999999999999e-54  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.289149  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2439  inositol-1-monophosphatase  48.07 
 
 
315 aa  211  7e-54  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2689  inositol-1-monophosphatase  42.38 
 
 
320 aa  211  9e-54  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0179732  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1076  inositol monophosphatase  44.49 
 
 
263 aa  209  3e-53  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0543949  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0984  Inositol-phosphate phosphatase  44.53 
 
 
284 aa  209  3e-53  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.594779  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2186  inositol monophosphatase  40.39 
 
 
259 aa  210  3e-53  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2063  Inositol-phosphate phosphatase  43.75 
 
 
259 aa  209  3e-53  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.948209  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3566  inositol monophosphatase  45.49 
 
 
353 aa  209  5e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0898  Inositol-phosphate phosphatase  39.13 
 
 
265 aa  208  9e-53  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000281614  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2428  inositol monophosphatase  41.95 
 
 
267 aa  208  9e-53  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.857801  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1160  inositol monophosphatase  40.3 
 
 
270 aa  207  1e-52  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.728684  normal  0.192207 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1510  inositol monophosphatase  44.49 
 
 
266 aa  207  1e-52  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2070  inositol monophosphatase  46.35 
 
 
313 aa  207  1e-52  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.662366  normal  0.672639 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2282  inositol monophosphatase  43.92 
 
 
266 aa  207  2e-52  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.476526  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3293  inositol-1(or 4)-monophosphatase  47.01 
 
 
328 aa  207  2e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.657669  normal  0.273671 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2518  Inositol-phosphate phosphatase  43.19 
 
 
267 aa  207  2e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0217752  hitchhiker  0.00000560671 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0004  inositol-phosphate phosphatase  43.88 
 
 
260 aa  207  2e-52  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1934  inositol-1-monophosphatase  42.75 
 
 
363 aa  206  3e-52  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.141779  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1454  inositol monophosphatase  41.53 
 
 
267 aa  206  3e-52  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00259546  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1219  Inositol-phosphate phosphatase  42.91 
 
 
256 aa  206  3e-52  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2892  inositol-1(or 4)-monophosphatase  43.53 
 
 
300 aa  206  4e-52  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1619  inositol-1(or 4)-monophosphatase  42.8 
 
 
267 aa  206  4e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.28291 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2706  inositol monophosphatase  45.45 
 
 
266 aa  205  6e-52  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000310915 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0963  Inositol-phosphate phosphatase  46.98 
 
 
322 aa  205  8e-52  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.220962  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1554  inositol monophosphatase  45.38 
 
 
269 aa  203  2e-51  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.475053  normal  0.933362 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01351  inositol-1-monophosphatase  41.9 
 
 
255 aa  203  2e-51  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.104947  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1232  inositol-1(or 4)-monophosphatase  40.32 
 
 
259 aa  203  2e-51  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.223718  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1380  inositol-phosphate phosphatase  48.25 
 
 
330 aa  203  2e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.135454  hitchhiker  0.00587687 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1045  inositol-phosphate phosphatase  46.98 
 
 
347 aa  204  2e-51  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0806171 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0719  inositol-1(or 4)-monophosphatase  41.86 
 
 
265 aa  202  4e-51  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000761228  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1028  inositol monophosphatase  41.08 
 
 
269 aa  202  5e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00157763  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1397  inositol-phosphate phosphatase  43.36 
 
 
267 aa  202  6e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.500053  hitchhiker  0.000599171 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2935  inositol monophosphatase  43.32 
 
 
263 aa  201  7e-51  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.932789  normal  0.110329 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1295  extragenic suppressor protein SuhB  42.08 
 
 
271 aa  202  7e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3515  inositol-phosphate phosphatase  41.7 
 
 
271 aa  200  3e-50  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.588619 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1681  inositol monophosphatase  42.41 
 
 
268 aa  199  3.9999999999999996e-50  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14680  extragenic suppressor protein SuhB  41.7 
 
 
271 aa  199  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40440  Inositol-1-monophosphatase  42.47 
 
 
268 aa  199  6e-50  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.443027  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0128  inositol monophosphatase  45.35 
 
 
258 aa  198  7e-50  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1173  Inositol-phosphate phosphatase  42.91 
 
 
261 aa  198  7e-50  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2060  inositol-1(or 4)-monophosphatase  42.21 
 
 
282 aa  198  7.999999999999999e-50  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.855853 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3034  inositol monophosphatase  43.03 
 
 
267 aa  198  9e-50  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.251178  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1419  inositol-1-monophosphatase  42.69 
 
 
271 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.57884  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1244  inositol-phosphate phosphatase  42.31 
 
 
266 aa  197  1.0000000000000001e-49  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2609  inositol monophosphatase family protein  41.88 
 
 
270 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1233  inositol monophosphatase  42.31 
 
 
271 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.901192  normal  0.728065 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1990  inositol-phosphate phosphatase  42.35 
 
 
267 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.410735 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004363  myo-inositol-1(or 4)-monophosphatase  40.65 
 
 
267 aa  197  2.0000000000000003e-49  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000312516  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5391  inositol-1(or 4)-monophosphatase  42.35 
 
 
267 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.268577  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1484  inositol-phosphate phosphatase  43.19 
 
 
266 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.145709  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2104  inositol-phosphate phosphatase  42.35 
 
 
267 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.466762 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5992  inositol monophosphatase  42.35 
 
 
267 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2120  inositol monophosphatase  42.35 
 
 
267 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2085  inositol monophosphatase  42.35 
 
 
267 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.150342  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2273  inositol monophosphatase  39.45 
 
 
266 aa  196  3e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0668825  normal  0.139934 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1196  inositol-phosphate phosphatase  42.35 
 
 
294 aa  196  3e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0278883 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0888  inositol monophosphatase  41.76 
 
 
269 aa  196  4.0000000000000005e-49  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0122019  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3030  inositol monophosphatase  41.2 
 
 
268 aa  196  4.0000000000000005e-49  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0983926  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1101  inositol monophosphatase  41.86 
 
 
267 aa  196  4.0000000000000005e-49  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0220453  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0054  inositol monophosphatase  44.17 
 
 
255 aa  195  6e-49  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.56898  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>