More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_4997 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013037  Dfer_4997  Inositol-phosphate phosphatase  100 
 
 
264 aa  544  1e-154  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000132366  normal  0.733856 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2273  inositol monophosphatase  63.08 
 
 
266 aa  345  4e-94  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0668825  normal  0.139934 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2935  inositol monophosphatase  53.23 
 
 
263 aa  273  2.0000000000000002e-72  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.932789  normal  0.110329 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3258  inositol-1-monophosphatase  46.95 
 
 
272 aa  258  6e-68  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.506114  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0672  inositol-1(or 4)-monophosphatase  42.35 
 
 
273 aa  216  2.9999999999999998e-55  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.000135062  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0813  inositol monophosphatase  41.41 
 
 
268 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000261138  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1280  inositol-1-monophosphatase  42.69 
 
 
266 aa  211  1e-53  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1231  myo-inositol-1(or 4)-monophosphatase  42.29 
 
 
263 aa  210  2e-53  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0360912  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0854  inositol monophosphatase  40.48 
 
 
262 aa  209  3e-53  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1681  inositol monophosphatase  44.53 
 
 
268 aa  208  7e-53  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2439  inositol-1-monophosphatase  42.37 
 
 
315 aa  207  1e-52  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2841  inositol-1(or 4)-monophosphatase  40.38 
 
 
330 aa  207  2e-52  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.202978  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0669  inositol monophosphate family protein  42.46 
 
 
267 aa  207  2e-52  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0614  inositol monophosphatase  43.15 
 
 
266 aa  207  2e-52  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000550019  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0818  Inositol-phosphate phosphatase  42.46 
 
 
267 aa  207  2e-52  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0219186  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2282  inositol monophosphatase  43.43 
 
 
266 aa  206  3e-52  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.476526  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1619  inositol-1(or 4)-monophosphatase  39.68 
 
 
267 aa  203  2e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.28291 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1321  inositol-phosphate phosphatase  42.69 
 
 
262 aa  203  2e-51  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0218475  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1410  inositol-1(or 4)-monophosphatase  40 
 
 
267 aa  202  5e-51  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0078  inositol-phosphate phosphatase  41.83 
 
 
270 aa  201  7e-51  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.105293 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1289  extragenic suppressor protein SuhB  39.6 
 
 
267 aa  201  9e-51  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.077456  normal  0.0155379 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0984  Inositol-phosphate phosphatase  39.68 
 
 
284 aa  201  9.999999999999999e-51  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.594779  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2186  inositol monophosphatase  40.39 
 
 
259 aa  201  9.999999999999999e-51  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3566  inositol monophosphatase  42.86 
 
 
353 aa  200  1.9999999999999998e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1160  inositol monophosphatase  37.45 
 
 
268 aa  200  1.9999999999999998e-50  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00412225  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1218  inositol-phosphate phosphatase  37.69 
 
 
431 aa  200  1.9999999999999998e-50  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0500  Inositol-phosphate phosphatase  39.92 
 
 
261 aa  200  1.9999999999999998e-50  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1160  inositol monophosphatase  39.92 
 
 
270 aa  199  3e-50  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.728684  normal  0.192207 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1407  inositol monophosphatase  40.23 
 
 
263 aa  199  5e-50  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.805923  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1712  hypothetical protein  39.77 
 
 
261 aa  198  6e-50  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1712  hypothetical protein  39.77 
 
 
261 aa  198  6e-50  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2060  inositol-1(or 4)-monophosphatase  40.15 
 
 
282 aa  198  7.999999999999999e-50  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.855853 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2153  inositol-phosphate phosphatase  39.2 
 
 
267 aa  197  1.0000000000000001e-49  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.38913  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2101  inositol-phosphate phosphatase  41.35 
 
 
267 aa  197  1.0000000000000001e-49  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0413503  hitchhiker  0.00162908 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2518  Inositol-phosphate phosphatase  38.49 
 
 
267 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0217752  hitchhiker  0.00000560671 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0018  inositol monophosphatase  43.08 
 
 
266 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000389361  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2309  inositol-phosphate phosphatase  43.72 
 
 
304 aa  196  3e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.315096 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2260  extragenic suppressor protein SuhB  39.6 
 
 
267 aa  196  3e-49  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1735  inositol-phosphate phosphatase  39.2 
 
 
267 aa  196  3e-49  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000203014  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2284  inositol monophosphatase  39.2 
 
 
267 aa  196  3e-49  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00357051  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2605  inositol monophosphatase family protein  40.48 
 
 
267 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3149  inositol-1-monophosphatase  40.48 
 
 
267 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.231747  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1664  inositol-1-monophosphatase  40.48 
 
 
267 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0475156  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1095  Inositol-phosphate phosphatase  39.61 
 
 
270 aa  196  4.0000000000000005e-49  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.47624 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1076  inositol monophosphatase  41.37 
 
 
263 aa  196  4.0000000000000005e-49  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0543949  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1934  inositol-1-monophosphatase  40.87 
 
 
363 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.141779  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2553  inositol monophosphatase family protein  40.48 
 
 
267 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1554  inositol monophosphatase  43.97 
 
 
269 aa  196  4.0000000000000005e-49  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.475053  normal  0.933362 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1441  inositol-1-monophosphatase  40.48 
 
 
267 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.115628  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2168  inositol-1-monophosphatase  40.48 
 
 
267 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.289149  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2689  inositol-1-monophosphatase  40.48 
 
 
320 aa  195  5.000000000000001e-49  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0179732  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1001  Inositol-phosphate phosphatase  39.61 
 
 
270 aa  195  5.000000000000001e-49  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.165549  normal  0.0783515 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0963  Inositol-phosphate phosphatase  42.86 
 
 
322 aa  196  5.000000000000001e-49  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.220962  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0543  inositol-phosphate phosphatase  39.53 
 
 
263 aa  195  6e-49  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0054  inositol monophosphatase  38.1 
 
 
255 aa  195  6e-49  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.56898  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4248  inositol-phosphate phosphatase  42.42 
 
 
297 aa  195  7e-49  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0646891  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1045  inositol-phosphate phosphatase  42.86 
 
 
347 aa  195  8.000000000000001e-49  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0806171 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1815  inositol-phosphate phosphatase  38.8 
 
 
267 aa  194  1e-48  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00063204  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0561  Inositol-phosphate phosphatase  41.18 
 
 
268 aa  194  1e-48  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2070  inositol monophosphatase  41.48 
 
 
313 aa  194  1e-48  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.662366  normal  0.672639 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1454  inositol monophosphatase  41.63 
 
 
267 aa  194  2e-48  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00259546  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1711  inositol monophosphatase family protein  39.83 
 
 
263 aa  193  3e-48  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.558759  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2892  inositol-1(or 4)-monophosphatase  39.08 
 
 
300 aa  193  3e-48  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3185  inositol monophosphatase  40.69 
 
 
264 aa  193  3e-48  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.777404  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1957  Inositol-phosphate phosphatase  38 
 
 
267 aa  192  4e-48  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000619286  normal  0.0182477 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2401  inositol-phosphate phosphatase  38 
 
 
267 aa  192  4e-48  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0002318  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0661  Inositol-phosphate phosphatase  42.08 
 
 
265 aa  192  4e-48  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.432346  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3672  extragenic suppressor protein SuhB  43.29 
 
 
266 aa  192  4e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2506  inositol-phosphate phosphatase  38 
 
 
267 aa  192  4e-48  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.024533  normal  0.0296693 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2390  inositol-phosphate phosphatase  38 
 
 
267 aa  192  4e-48  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000252035  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2609  inositol monophosphatase family protein  43.46 
 
 
270 aa  192  6e-48  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2428  inositol monophosphatase  40.77 
 
 
267 aa  192  6e-48  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.857801  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0161  extragenic suppressor protein SuhB  39.43 
 
 
267 aa  191  7e-48  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.17708  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1028  inositol monophosphatase  40.18 
 
 
269 aa  192  7e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00157763  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0719  inositol-1(or 4)-monophosphatase  40 
 
 
265 aa  191  9e-48  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000761228  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0274  inositol monophosphate family protein  37.94 
 
 
288 aa  191  1e-47  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.578849  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2063  Inositol-phosphate phosphatase  39.13 
 
 
259 aa  191  1e-47  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.948209  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1653  inositol monophosphatase family protein  39.39 
 
 
263 aa  191  1e-47  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1078  inositol monophosphatase  39.06 
 
 
273 aa  190  2e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.701332  normal  0.180258 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2588  inositol-phosphate phosphatase  39.45 
 
 
265 aa  191  2e-47  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1639  inositol-1(or 4)-monophosphatase  41.6 
 
 
293 aa  189  2.9999999999999997e-47  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3293  inositol-1(or 4)-monophosphatase  39.39 
 
 
328 aa  189  2.9999999999999997e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.657669  normal  0.273671 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1772  inositol-phosphate phosphatase  39.36 
 
 
283 aa  189  4e-47  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.32038  hitchhiker  0.00184964 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2875  inositol-phosphate phosphatase  38.55 
 
 
267 aa  189  4e-47  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000220191 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1115  inositol-1(or 4)-monophosphatase  41.02 
 
 
274 aa  188  7e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2706  inositol monophosphatase  41.67 
 
 
266 aa  188  7e-47  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000310915 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1510  inositol monophosphatase  39.46 
 
 
266 aa  188  8e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1244  inositol-phosphate phosphatase  37.25 
 
 
266 aa  188  9e-47  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1205  inositol-phosphate phosphatase  42.2 
 
 
263 aa  187  1e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.7767  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3316  inositol monophosphatase  37.7 
 
 
262 aa  187  1e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.546431 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0385  Inositol-phosphate phosphatase  36.74 
 
 
272 aa  187  1e-46  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.391446  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2665  inositol-phosphate phosphatase  41.99 
 
 
266 aa  187  2e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.887492  normal  0.378141 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0898  Inositol-phosphate phosphatase  38.26 
 
 
265 aa  187  2e-46  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000281614  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3055  inositol-phosphate phosphatase  35.69 
 
 
262 aa  186  4e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.00295141  normal  0.1713 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2321  inositol monophosphatase  37.6 
 
 
267 aa  186  4e-46  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000655872  normal  0.931835 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6932  inositol monophosphatase  35.94 
 
 
263 aa  186  4e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.538744 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1101  inositol monophosphatase  40.69 
 
 
267 aa  185  5e-46  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0220453  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1241  inositol monophosphatase  38.19 
 
 
267 aa  186  5e-46  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.921359  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7280  inositol monophosphatase  38.52 
 
 
264 aa  184  9e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0255139  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3515  inositol-phosphate phosphatase  40.66 
 
 
271 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.588619 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>