17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_5251 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_5251  protein of unknown function DUF177  100 
 
 
182 aa  374  1e-103  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000155726  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4154  protein of unknown function DUF177  49.16 
 
 
202 aa  158  4e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.396249 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1626  hypothetical protein  38.46 
 
 
189 aa  130  1.0000000000000001e-29  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0411275  hitchhiker  0.00685696 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3814  protein of unknown function DUF177  34.81 
 
 
177 aa  114  6.9999999999999995e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.234061  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02335  hypothetical protein  33.52 
 
 
175 aa  103  2e-21  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0710  hypothetical protein  38.14 
 
 
143 aa  102  4e-21  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.304677 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0648  hypothetical protein  27.37 
 
 
180 aa  96.3  2e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.217641  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0207  protein of unknown function DUF177  30.22 
 
 
176 aa  92.4  4e-18  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6297  protein of unknown function DUF177  30.16 
 
 
178 aa  79.3  0.00000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.986154  normal  0.558296 
 
 
-
 
NC_002950  PG2139  hypothetical protein  27.27 
 
 
159 aa  65.1  0.0000000005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0185  protein of unknown function DUF177  28 
 
 
174 aa  46.6  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00648042  normal  0.827774 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0180  protein of unknown function DUF177  26.67 
 
 
176 aa  45.8  0.0003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.112746  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1730  hypothetical protein  26 
 
 
161 aa  45.4  0.0004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000131873  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0202  protein of unknown function DUF177  27.34 
 
 
179 aa  43.9  0.001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0175804  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06081  metal-binding protein  25 
 
 
176 aa  42.7  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.122507 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1216  hypothetical protein  27.54 
 
 
166 aa  40.8  0.01  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000247083  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1788  hypothetical protein  22.67 
 
 
172 aa  40.8  0.01  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.190801  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>