14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_0202 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_0202  protein of unknown function DUF177  100 
 
 		 179 aa  369  1e-101  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0175804  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0172  protein of unknown function DUF177  52.84 
 
 		 175 aa  182  3e-45  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2487  hypothetical protein  52.3 
 
 		 175 aa  177  9e-44  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0136  hypothetical protein  43.65 
 
 		 179 aa  142  2e-33  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  unclonable  0.000000000033624  normal  0.854848 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0185  protein of unknown function DUF177  43.1 
 
 		 174 aa  143  2e-33  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00648042  normal  0.827774 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0180  protein of unknown function DUF177  41.95 
 
 		 176 aa  136  2e-31  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.112746  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1667  hypothetical protein  37.29 
 
 		 206 aa  128  5.0000000000000004e-29  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.423652  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0826  protein of unknown function DUF177  28.57 
 
 		 175 aa  47.8  0.00009  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000168903  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5251  protein of unknown function DUF177  27.34 
 
 		 182 aa  44.7  0.0007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000155726  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1596  hypothetical protein  21.9 
 
 		 179 aa  43.1  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  1.3780500000000002e-18  normal  0.312319 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2079  hypothetical protein  26.4 
 
 		 166 aa  43.5  0.002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0352499  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3111  protein of unknown function DUF177  23.93 
 
 		 185 aa  42.7  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0354098  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1151  protein of unknown function DUF177  23.93 
 
 		 178 aa  42.4  0.003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1104  protein of unknown function DUF177  26.73 
 
 		 187 aa  42  0.005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000578932  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>