11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_0172 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010803  Clim_0172  protein of unknown function DUF177  100 
 
 
175 aa  362  1e-99  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2487  hypothetical protein  52 
 
 
175 aa  186  1e-46  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0202  protein of unknown function DUF177  52.84 
 
 
179 aa  182  3e-45  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0175804  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0185  protein of unknown function DUF177  50 
 
 
174 aa  169  3e-41  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00648042  normal  0.827774 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0136  hypothetical protein  46.93 
 
 
179 aa  160  6e-39  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  unclonable  0.000000000033624  normal  0.854848 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0180  protein of unknown function DUF177  42.94 
 
 
176 aa  154  4e-37  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.112746  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1667  hypothetical protein  37.99 
 
 
206 aa  122  3e-27  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.423652  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0797  hypothetical protein  27.36 
 
 
182 aa  46.2  0.0003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00000798674  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0774  hypothetical protein  27.36 
 
 
182 aa  45.4  0.0004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000032907  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3825  protein of unknown function DUF177  26.35 
 
 
169 aa  43.5  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000165612  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2782  hypothetical protein  25.66 
 
 
184 aa  40.8  0.01  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0822851  normal  0.161111 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>