13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_2487 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008639  Cpha266_2487  hypothetical protein  100 
 
 
175 aa  358  2e-98  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0172  protein of unknown function DUF177  52 
 
 
175 aa  186  1e-46  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0202  protein of unknown function DUF177  52.3 
 
 
179 aa  177  8e-44  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0175804  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0136  hypothetical protein  45.81 
 
 
179 aa  162  3e-39  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  unclonable  0.000000000033624  normal  0.854848 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0180  protein of unknown function DUF177  45.14 
 
 
176 aa  159  2e-38  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.112746  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0185  protein of unknown function DUF177  45.76 
 
 
174 aa  155  2e-37  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00648042  normal  0.827774 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1667  hypothetical protein  37.43 
 
 
206 aa  122  2e-27  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.423652  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2079  hypothetical protein  31.73 
 
 
166 aa  54.7  0.0000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0352499  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2806  protein of unknown function DUF177  26.15 
 
 
164 aa  45.1  0.0005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3111  protein of unknown function DUF177  27.87 
 
 
185 aa  43.1  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0354098  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1151  protein of unknown function DUF177  27.87 
 
 
178 aa  43.1  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0941  hypothetical protein  34.65 
 
 
193 aa  42  0.004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000248202  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1805  hypothetical protein  26.23 
 
 
182 aa  40.8  0.009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>