22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_2806 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_2806  protein of unknown function DUF177  100 
 
 		 164 aa  326  1.0000000000000001e-88  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1667  hypothetical protein  30.86 
 
 		 206 aa  64.7  0.0000000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.423652  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0185  protein of unknown function DUF177  29.76 
 
 		 174 aa  60.5  0.000000009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00648042  normal  0.827774 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1374  protein of unknown function DUF177  36.43 
 
 		 219 aa  55.8  0.0000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0131321  normal  0.107078 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02335  hypothetical protein  25.44 
 
 		 175 aa  51.2  0.000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0648  hypothetical protein  27.46 
 
 		 180 aa  49.3  0.00002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.217641  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2487  hypothetical protein  26.32 
 
 		 175 aa  48.9  0.00003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2120  hypothetical protein  30.66 
 
 		 183 aa  48.1  0.00006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.16235 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0180  protein of unknown function DUF177  24.12 
 
 		 176 aa  47.8  0.00007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.112746  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3814  protein of unknown function DUF177  25.55 
 
 		 177 aa  46.6  0.0001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.234061  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0136  hypothetical protein  32.5 
 
 		 179 aa  45.4  0.0003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  unclonable  0.000000000033624  normal  0.854848 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1208  hypothetical protein  25.47 
 
 		 185 aa  45.4  0.0003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000132249  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1186  hypothetical protein  25.47 
 
 		 185 aa  45.4  0.0003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.0000000152824  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1576  hypothetical protein  33.58 
 
 		 185 aa  45.8  0.0003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0723626 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0172  protein of unknown function DUF177  25.44 
 
 		 175 aa  44.3  0.0008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0207  protein of unknown function DUF177  25.75 
 
 		 176 aa  43.9  0.0009  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1375  hypothetical protein  28.91 
 
 		 152 aa  43.1  0.002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.178542  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5966  protein of unknown function DUF177  31.78 
 
 		 148 aa  42.4  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1881  protein of unknown function DUF177  29.29 
 
 		 185 aa  42  0.004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0908518  normal  0.0184273 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4143  hypothetical protein  31.82 
 
 		 183 aa  41.6  0.005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.155219 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3435  protein of unknown function DUF177  29.1 
 
 		 195 aa  40.8  0.008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.756504  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0717  hypothetical protein  22.58 
 
 		 184 aa  40.4  0.009  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  unclonable  0.0000000000000615764  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>