13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Paes_0180 on replicon NC_011059
Organism: Prosthecochloris aestuarii DSM 271



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011059  Paes_0180  protein of unknown function DUF177  100 
 
 
176 aa  365  1e-100  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.112746  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0185  protein of unknown function DUF177  48.28 
 
 
174 aa  168  3e-41  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00648042  normal  0.827774 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2487  hypothetical protein  45.14 
 
 
175 aa  159  2e-38  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0136  hypothetical protein  45.25 
 
 
179 aa  155  3e-37  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  unclonable  0.000000000033624  normal  0.854848 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0172  protein of unknown function DUF177  42.94 
 
 
175 aa  154  4e-37  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0202  protein of unknown function DUF177  41.95 
 
 
179 aa  136  2e-31  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0175804  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1667  hypothetical protein  34.08 
 
 
206 aa  111  6e-24  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.423652  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3825  protein of unknown function DUF177  27.43 
 
 
169 aa  44.7  0.0007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000165612  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3111  protein of unknown function DUF177  29.06 
 
 
185 aa  44.3  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0354098  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1151  protein of unknown function DUF177  29.06 
 
 
178 aa  43.9  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2806  protein of unknown function DUF177  25.95 
 
 
164 aa  43.9  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5251  protein of unknown function DUF177  25.76 
 
 
182 aa  41.6  0.005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000155726  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0951  protein of unknown function DUF177  34.67 
 
 
179 aa  40.8  0.01  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.000000012525  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>