16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_0185 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_0185  protein of unknown function DUF177  100 
 
 
174 aa  357  5e-98  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00648042  normal  0.827774 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0172  protein of unknown function DUF177  50 
 
 
175 aa  169  3e-41  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0180  protein of unknown function DUF177  48.28 
 
 
176 aa  168  3e-41  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.112746  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2487  hypothetical protein  45.76 
 
 
175 aa  155  2e-37  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0202  protein of unknown function DUF177  43.1 
 
 
179 aa  143  1e-33  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0175804  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0136  hypothetical protein  42.94 
 
 
179 aa  143  2e-33  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  unclonable  0.000000000033624  normal  0.854848 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1667  hypothetical protein  30.99 
 
 
206 aa  97.1  1e-19  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.423652  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2806  protein of unknown function DUF177  29.76 
 
 
164 aa  54.3  0.0000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5251  protein of unknown function DUF177  28 
 
 
182 aa  47.4  0.00009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000155726  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0474  hypothetical protein  29.29 
 
 
182 aa  45.1  0.0005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.000014524  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0774  hypothetical protein  26.95 
 
 
182 aa  44.7  0.0007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000032907  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0797  hypothetical protein  25.83 
 
 
182 aa  42.4  0.003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00000798674  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3435  protein of unknown function DUF177  26.53 
 
 
195 aa  42  0.004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.756504  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2079  hypothetical protein  22.79 
 
 
166 aa  41.2  0.007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0352499  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4031  protein of unknown function DUF177  28 
 
 
215 aa  41.2  0.007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3825  protein of unknown function DUF177  22.41 
 
 
169 aa  40.8  0.01  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000165612  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>