23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9303_06081 on replicon NC_008820
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9303



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008820  P9303_06081  metal-binding protein  100 
 
 
176 aa  362  1e-99  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.122507 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0576  hypothetical protein  52.1 
 
 
178 aa  186  1e-46  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1788  hypothetical protein  48.3 
 
 
172 aa  184  8e-46  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.190801  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0963  protein of unknown function DUF177  41.18 
 
 
167 aa  114  6e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.132362 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4712  hypothetical protein  37.16 
 
 
169 aa  114  7.999999999999999e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0945852  normal  0.92586 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1619  metal-binding protein  41.94 
 
 
168 aa  113  1.0000000000000001e-24  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.056507 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0371  protein of unknown function DUF177  39.19 
 
 
167 aa  112  3e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.223895  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0364  protein of unknown function DUF177  39.19 
 
 
167 aa  112  3e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0689  hypothetical protein  35.66 
 
 
168 aa  100  7e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.853338  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5263  protein of unknown function DUF177  36.05 
 
 
167 aa  100  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.23091  normal  0.0658863 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3437  hypothetical protein  34.42 
 
 
169 aa  99.8  2e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1730  hypothetical protein  29.75 
 
 
161 aa  50.8  0.000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000131873  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3814  protein of unknown function DUF177  25.34 
 
 
177 aa  48.9  0.00004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.234061  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10850  predicted metal-binding protein, possibly nucleic-acid binding  25.85 
 
 
187 aa  46.6  0.0002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00522306  normal  0.125771 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1872  hypothetical protein  27.73 
 
 
178 aa  43.9  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000360622  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0939  protein of unknown function DUF177  24.18 
 
 
179 aa  44.3  0.001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000128856  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0941  hypothetical protein  26.55 
 
 
193 aa  43.9  0.001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000248202  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1576  hypothetical protein  28.46 
 
 
185 aa  43.1  0.002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0723626 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1374  protein of unknown function DUF177  30.47 
 
 
219 aa  42.4  0.004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0131321  normal  0.107078 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0769  metal-binding protein  25 
 
 
186 aa  42.4  0.004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000160952  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4031  protein of unknown function DUF177  26.16 
 
 
215 aa  41.6  0.006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0826  protein of unknown function DUF177  28.41 
 
 
175 aa  41.2  0.007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000168903  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1843  hypothetical protein  26.58 
 
 
187 aa  40.8  0.01  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00000297886  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>