28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_3814 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013061  Phep_3814  protein of unknown function DUF177  100 
 
 
177 aa  356  8e-98  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.234061  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02335  hypothetical protein  39.89 
 
 
175 aa  122  3e-27  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0648  hypothetical protein  39.33 
 
 
180 aa  119  1.9999999999999998e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.217641  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0207  protein of unknown function DUF177  35.39 
 
 
176 aa  106  1e-22  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5251  protein of unknown function DUF177  32.42 
 
 
182 aa  106  2e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000155726  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6297  protein of unknown function DUF177  35.29 
 
 
178 aa  104  7e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.986154  normal  0.558296 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4154  protein of unknown function DUF177  32.07 
 
 
202 aa  83.6  0.000000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.396249 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1626  hypothetical protein  33.88 
 
 
189 aa  81.3  0.000000000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0411275  hitchhiker  0.00685696 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0710  hypothetical protein  32.56 
 
 
143 aa  73.9  0.000000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.304677 
 
 
-
 
NC_002950  PG2139  hypothetical protein  29.94 
 
 
159 aa  70.5  0.00000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1788  hypothetical protein  21.6 
 
 
172 aa  50.4  0.00001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.190801  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06081  metal-binding protein  25.34 
 
 
176 aa  48.9  0.00004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.122507 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1566  protein of unknown function DUF177  25 
 
 
194 aa  47.4  0.0001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0425556  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1136  hypothetical protein  25.18 
 
 
194 aa  45.8  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.103256  normal  0.0238581 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0963  protein of unknown function DUF177  23.58 
 
 
167 aa  45.1  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.132362 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1005  protein of unknown function DUF177  26.52 
 
 
181 aa  45.1  0.0005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0769  metal-binding protein  23.95 
 
 
186 aa  43.5  0.001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000160952  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1173  protein of unknown function DUF177  23.35 
 
 
172 aa  43.9  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000208772  normal  0.0342021 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1730  hypothetical protein  28.19 
 
 
161 aa  42.7  0.003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000131873  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1374  protein of unknown function DUF177  23.74 
 
 
219 aa  42.4  0.003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0131321  normal  0.107078 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0826  protein of unknown function DUF177  26.92 
 
 
175 aa  42  0.004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000168903  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2120  hypothetical protein  20.62 
 
 
183 aa  42  0.004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.16235 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1881  protein of unknown function DUF177  25.5 
 
 
185 aa  41.6  0.005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0908518  normal  0.0184273 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1151  protein of unknown function DUF177  29.69 
 
 
178 aa  41.6  0.006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1877  protein of unknown function DUF177  28.46 
 
 
179 aa  41.2  0.007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3111  protein of unknown function DUF177  28.91 
 
 
185 aa  40.8  0.009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0354098  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1216  hypothetical protein  25.21 
 
 
166 aa  40.8  0.01  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000247083  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4025  hypothetical protein  25.21 
 
 
166 aa  40.8  0.01  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000964591  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>