77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_1374 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_1374  protein of unknown function DUF177  100 
 
 		 219 aa  439  9.999999999999999e-123  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0131321  normal  0.107078 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2295  protein of unknown function DUF177  50.27 
 
 		 191 aa  177  1e-43  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0450584  hitchhiker  0.00203125 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2275  protein of unknown function DUF177  53.63 
 
 		 184 aa  173  9.999999999999999e-43  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3282  hypothetical protein  52.25 
 
 		 192 aa  168  6e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1284  hypothetical protein  52.84 
 
 		 187 aa  165  4e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7997  metal-binding possibly nucleic acid-binding protein-like protein  50.8 
 
 		 184 aa  165  5.9999999999999996e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.268781  normal  0.495874 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1174  hypothetical protein  52.27 
 
 		 187 aa  163  2.0000000000000002e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000602797 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11270  predicted metal-binding protein, possibly nucleic-acid binding  47.62 
 
 		 191 aa  162  3e-39  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0459929 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3435  protein of unknown function DUF177  49.47 
 
 		 195 aa  162  4.0000000000000004e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.756504  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2503  hypothetical protein  53.25 
 
 		 174 aa  160  2e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.911194  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1607  protein of unknown function DUF177  48.44 
 
 		 192 aa  153  2e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0562637  normal  0.911119 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8019  protein of unknown function DUF177  49.72 
 
 		 204 aa  148  6e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.343031  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2782  hypothetical protein  46.99 
 
 		 184 aa  146  3e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0822851  normal  0.161111 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2170  hypothetical protein  48.22 
 
 		 197 aa  142  3e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.782155  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1948  hypothetical protein  48.59 
 
 		 189 aa  140  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1928  hypothetical protein  48.59 
 
 		 189 aa  140  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1994  hypothetical protein  48.59 
 
 		 189 aa  140  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.486572  normal  0.358979 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3604  hypothetical protein  45 
 
 		 203 aa  139  4.999999999999999e-32  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4193  hypothetical protein  46.11 
 
 		 196 aa  138  7e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.711363 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4031  protein of unknown function DUF177  46.86 
 
 		 215 aa  137  1e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0649  hypothetical protein  41.5 
 
 		 202 aa  136  3.0000000000000003e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.865201  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1136  hypothetical protein  47.67 
 
 		 194 aa  135  6.0000000000000005e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.103256  normal  0.0238581 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0210  protein of unknown function DUF177  42.02 
 
 		 192 aa  135  7.000000000000001e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1881  protein of unknown function DUF177  44.04 
 
 		 185 aa  131  1.0000000000000001e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0908518  normal  0.0184273 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12941  hypothetical protein  45.16 
 
 		 207 aa  130  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10850  predicted metal-binding protein, possibly nucleic-acid binding  43.96 
 
 		 187 aa  129  4.0000000000000003e-29  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00522306  normal  0.125771 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1576  hypothetical protein  46.82 
 
 		 185 aa  128  8.000000000000001e-29  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0723626 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1668  protein of unknown function DUF177  42.69 
 
 		 176 aa  126  2.0000000000000002e-28  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.323385  normal  0.0100711 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2120  hypothetical protein  42.94 
 
 		 183 aa  126  3e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.16235 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1566  protein of unknown function DUF177  39.77 
 
 		 194 aa  123  2e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0425556  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08880  predicted metal-binding protein, possibly nucleic-acid binding  43.32 
 
 		 190 aa  122  5e-27  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.486062  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2071  protein of unknown function DUF177  44.72 
 
 		 193 aa  120  1.9999999999999998e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.972003  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5966  protein of unknown function DUF177  44.9 
 
 		 148 aa  107  2e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09470  predicted metal-binding protein, possibly nucleic-acid binding  41.62 
 
 		 200 aa  102  3e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.164362 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18370  predicted metal-binding protein, possibly nucleic-acid binding  38.33 
 
 		 198 aa  101  1e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0334  hypothetical protein  29.17 
 
 		 209 aa  82  0.000000000000006  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1039  putative metal-binding/nucleic acid-binding protein  25.79 
 
 		 209 aa  70.5  0.00000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0856  protein of unknown function DUF177  31.87 
 
 		 189 aa  61.2  0.00000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2612  hypothetical protein  34.09 
 
 		 182 aa  57.8  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.801895 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0939  protein of unknown function DUF177  25.85 
 
 		 179 aa  57.4  0.0000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000128856  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1805  hypothetical protein  33.08 
 
 		 182 aa  54.3  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10040  predicted metal-binding protein, possibly nucleic-acid binding  35.92 
 
 		 183 aa  53.5  0.000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000141201  hitchhiker  0.000000328703 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1358  protein of unknown function DUF177  34.48 
 
 		 185 aa  53.5  0.000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0534521  normal  0.432426 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2742  hypothetical protein  28.86 
 
 		 186 aa  52.8  0.000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0662187  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3775  hypothetical protein  31.9 
 
 		 166 aa  50.8  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000000007922  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4063  hypothetical protein  31.9 
 
 		 166 aa  50.8  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000072434  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3977  hypothetical protein  31.9 
 
 		 166 aa  50.8  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.0000000334808  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3666  hypothetical protein  31.9 
 
 		 166 aa  50.8  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  4.580310000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3970  hypothetical protein  31.9 
 
 		 166 aa  50.8  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000472322  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3939  hypothetical protein  31.9 
 
 		 166 aa  50.8  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2845  protein of unknown function DUF177  29.03 
 
 		 186 aa  50.4  0.00002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.623121  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3683  hypothetical protein  31.9 
 
 		 166 aa  50.4  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000000198265  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05650  predicted metal-binding protein, possibly nucleic-acid binding  28.57 
 
 		 140 aa  50.4  0.00002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00861555  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1877  protein of unknown function DUF177  28 
 
 		 179 aa  50.1  0.00002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2937  protein of unknown function DUF177  29.03 
 
 		 186 aa  50.4  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2574  hypothetical protein  31.3 
 
 		 166 aa  50.1  0.00003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000736342  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4025  hypothetical protein  31.3 
 
 		 166 aa  49.3  0.00004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000964591  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1216  hypothetical protein  31.3 
 
 		 166 aa  49.3  0.00005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000247083  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0742  hypothetical protein  28.15 
 
 		 178 aa  48.9  0.00006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1647  protein of unknown function DUF177  26.52 
 
 		 186 aa  48.1  0.0001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1889  protein of unknown function DUF177  40 
 
 		 230 aa  46.6  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2806  protein of unknown function DUF177  36.43 
 
 		 164 aa  46.6  0.0003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2753  hypothetical protein  27.1 
 
 		 186 aa  46.6  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0951  protein of unknown function DUF177  29.93 
 
 		 179 aa  45.8  0.0005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.000000012525  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0769  metal-binding protein  30.28 
 
 		 186 aa  45.4  0.0006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000160952  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1433  hypothetical protein  29.08 
 
 		 185 aa  45.4  0.0007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000012888  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1173  protein of unknown function DUF177  22.79 
 
 		 172 aa  45.1  0.0008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000208772  normal  0.0342021 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3751  hypothetical protein  31.3 
 
 		 166 aa  44.3  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000323099  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1872  hypothetical protein  29.13 
 
 		 178 aa  44.7  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000360622  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1027  hypothetical protein  21.58 
 
 		 167 aa  43.5  0.002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000000775006  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0941  hypothetical protein  28.36 
 
 		 193 aa  43.9  0.002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000248202  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0826  protein of unknown function DUF177  21.15 
 
 		 175 aa  43.1  0.004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000168903  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06081  metal-binding protein  30.47 
 
 		 176 aa  42.4  0.006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.122507 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3814  protein of unknown function DUF177  23.74 
 
 		 177 aa  42.4  0.006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.234061  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1339  protein of unknown function DUF177  27.41 
 
 		 167 aa  42  0.007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.518128  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0636  hypothetical protein  29.27 
 
 		 172 aa  41.6  0.01  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.000000000112577  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0963  protein of unknown function DUF177  29.91 
 
 		 167 aa  41.6  0.01  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.132362 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>