27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_3129 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_3129  Protein of unknown function DUF2191  100 
 
 
71 aa  142  1e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1301  hypothetical protein  47.62 
 
 
69 aa  63.9  0.0000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00000150505  hitchhiker  0.00458479 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0684  hypothetical protein  49.18 
 
 
66 aa  62.8  0.000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000251429  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0549  hypothetical protein  46.03 
 
 
70 aa  61.6  0.000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2253  hypothetical protein  50 
 
 
64 aa  61.6  0.000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.381428  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0414  hypothetical protein  47.54 
 
 
92 aa  59.3  0.00000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0837  hypothetical protein  49.21 
 
 
64 aa  58.9  0.00000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.524341 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1883  hypothetical protein  47.54 
 
 
67 aa  59.3  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00517527  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2528  hypothetical protein  47.62 
 
 
64 aa  58.2  0.00000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11592  hypothetical protein  50.79 
 
 
72 aa  55.1  0.0000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.305e-26  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1521  hypothetical protein  41.38 
 
 
69 aa  53.9  0.0000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0375  hypothetical protein  44.83 
 
 
66 aa  53.1  0.000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.529371  normal  0.0790503 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3709  hypothetical protein  43.66 
 
 
70 aa  53.1  0.000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0707784 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4985  Protein of unknown function DUF2191  45.9 
 
 
73 aa  52.8  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.494262  normal  0.887949 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0231  hypothetical protein  50 
 
 
67 aa  52.4  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.355276 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0947  hypothetical protein  41.38 
 
 
66 aa  52  0.000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000156111  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0878  hypothetical protein  41.51 
 
 
65 aa  50.8  0.000007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00000140007  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1455  hypothetical protein  41.38 
 
 
70 aa  48.5  0.00003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4801  hypothetical protein  48.98 
 
 
70 aa  47.8  0.00005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.498712  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3830  hypothetical protein  31.03 
 
 
70 aa  47  0.00009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0196  hypothetical protein  37.7 
 
 
64 aa  46.6  0.0001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1160  hypothetical protein  30 
 
 
70 aa  46.2  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2434  hypothetical protein  40.32 
 
 
67 aa  47  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0941492 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4105  hypothetical protein  40.82 
 
 
112 aa  43.9  0.0007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.525193  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0410  hypothetical protein  42.86 
 
 
63 aa  43.1  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6100  antitoxin of a toxin/antitoxin system  39.06 
 
 
78 aa  42  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.192956 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6159  antitoxin of a toxin/antitoxin system  44.9 
 
 
65 aa  40  0.01  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>