18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_0549 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_0549  hypothetical protein  100 
 
 		 70 aa  134  3.0000000000000003e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0837  hypothetical protein  68.25 
 
 		 64 aa  83.6  9e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.524341 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2528  hypothetical protein  58.73 
 
 		 64 aa  77.8  0.00000000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2253  hypothetical protein  51.61 
 
 		 64 aa  72  0.000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.381428  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1883  hypothetical protein  54.55 
 
 		 67 aa  71.2  0.000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00517527  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0414  hypothetical protein  55.74 
 
 		 92 aa  70.1  0.000000000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3129  Protein of unknown function DUF2191  46.03 
 
 		 71 aa  61.6  0.000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3709  hypothetical protein  48.57 
 
 		 70 aa  60.1  0.000000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0707784 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1301  hypothetical protein  44.78 
 
 		 69 aa  54.3  0.0000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00000150505  hitchhiker  0.00458479 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11592  hypothetical protein  50 
 
 		 72 aa  53.5  0.000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.305e-26  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2434  hypothetical protein  40.62 
 
 		 67 aa  51.6  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0941492 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0684  hypothetical protein  39.34 
 
 		 66 aa  50.8  0.000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000251429  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0231  hypothetical protein  39.66 
 
 		 67 aa  46.2  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.355276 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0196  hypothetical protein  34.43 
 
 		 64 aa  43.5  0.001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1521  hypothetical protein  30.51 
 
 		 69 aa  42.4  0.002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1668  Protein of unknown function DUF2191  40.32 
 
 		 81 aa  41.2  0.005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.283328  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0597  hypothetical protein  38.1 
 
 		 68 aa  40  0.01  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0992352  normal  0.240372 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0588  Protein of unknown function DUF2191  38.1 
 
 		 68 aa  40  0.01  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.994089  normal  0.0127287 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>