13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_2434 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_2434  hypothetical protein  100 
 
 		 67 aa  134  3.0000000000000003e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0941492 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2253  hypothetical protein  53.23 
 
 		 64 aa  67.8  0.00000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.381428  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0414  hypothetical protein  46.88 
 
 		 92 aa  60.8  0.000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3709  hypothetical protein  52.38 
 
 		 70 aa  60.8  0.000000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0707784 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2528  hypothetical protein  52.63 
 
 		 64 aa  58.5  0.00000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0837  hypothetical protein  45.16 
 
 		 64 aa  57.4  0.00000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.524341 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1883  hypothetical protein  40.62 
 
 		 67 aa  54.7  0.0000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00517527  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0549  hypothetical protein  40.62 
 
 		 70 aa  51.6  0.000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0231  hypothetical protein  42.11 
 
 		 67 aa  47.8  0.00005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.355276 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3129  Protein of unknown function DUF2191  40.32 
 
 		 71 aa  47  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1301  hypothetical protein  40.32 
 
 		 69 aa  43.9  0.0007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00000150505  hitchhiker  0.00458479 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4105  hypothetical protein  40.82 
 
 		 112 aa  42  0.003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.525193  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11592  hypothetical protein  41.27 
 
 		 72 aa  42  0.003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.305e-26  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>