23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_4105 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_4105  hypothetical protein  100 
 
 		 112 aa  222  1e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.525193  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1521  hypothetical protein  40.98 
 
 		 69 aa  52  0.000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0375  hypothetical protein  36.92 
 
 		 66 aa  50.8  0.000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.529371  normal  0.0790503 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0878  hypothetical protein  36.67 
 
 		 65 aa  46.6  0.0001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00000140007  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0684  hypothetical protein  41.67 
 
 		 66 aa  46.2  0.0001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000251429  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0414  hypothetical protein  44.9 
 
 		 92 aa  45.4  0.0002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1455  hypothetical protein  36.67 
 
 		 70 aa  45.4  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4094  hypothetical protein  36.76 
 
 		 72 aa  45.4  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0947  hypothetical protein  40 
 
 		 66 aa  45.1  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000156111  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0588  Protein of unknown function DUF2191  52.38 
 
 		 68 aa  43.9  0.0007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.994089  normal  0.0127287 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0597  hypothetical protein  52.38 
 
 		 68 aa  43.9  0.0007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0992352  normal  0.240372 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3129  Protein of unknown function DUF2191  40.82 
 
 		 71 aa  43.9  0.0007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2253  hypothetical protein  38.98 
 
 		 64 aa  43.1  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.381428  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2528  hypothetical protein  38.98 
 
 		 64 aa  43.5  0.001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3709  hypothetical protein  44.23 
 
 		 70 aa  42.7  0.002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0707784 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1160  hypothetical protein  32.79 
 
 		 70 aa  42.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2434  hypothetical protein  40.82 
 
 		 67 aa  42  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0941492 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11592  hypothetical protein  51.92 
 
 		 72 aa  41.2  0.005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.305e-26  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4678  hypothetical protein  35.94 
 
 		 78 aa  40.4  0.008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0330  hypothetical protein  36.21 
 
 		 65 aa  40.4  0.008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4949  hypothetical protein  36.21 
 
 		 65 aa  40  0.01  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.398097  decreased coverage  0.00607131 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5319  hypothetical protein  36.21 
 
 		 65 aa  40  0.01  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.6152 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3047  hypothetical protein  36.21 
 
 		 65 aa  40  0.01  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.251694  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>