23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_0414 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007484  Noc_0414  hypothetical protein  100 
 
 
92 aa  191  3e-48  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2253  hypothetical protein  78.69 
 
 
64 aa  99.4  2e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.381428  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0837  hypothetical protein  70.49 
 
 
64 aa  86.7  9e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.524341 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2528  hypothetical protein  63.93 
 
 
64 aa  83.2  0.000000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1883  hypothetical protein  52.46 
 
 
67 aa  71.6  0.000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00517527  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0549  hypothetical protein  55.74 
 
 
70 aa  70.1  0.000000000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3709  hypothetical protein  56.25 
 
 
70 aa  64.3  0.0000000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0707784 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2434  hypothetical protein  46.88 
 
 
67 aa  60.8  0.000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0941492 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3129  Protein of unknown function DUF2191  47.54 
 
 
71 aa  59.3  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0231  hypothetical protein  44.83 
 
 
67 aa  53.5  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.355276 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1301  hypothetical protein  50 
 
 
69 aa  52.4  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00000150505  hitchhiker  0.00458479 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0375  hypothetical protein  41.38 
 
 
66 aa  47.8  0.00005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.529371  normal  0.0790503 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11592  hypothetical protein  41.43 
 
 
72 aa  46.6  0.0001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.305e-26  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4105  hypothetical protein  44.9 
 
 
112 aa  45.4  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.525193  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1521  hypothetical protein  37.93 
 
 
69 aa  46.2  0.0002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0684  hypothetical protein  34.85 
 
 
66 aa  44.7  0.0005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000251429  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0588  Protein of unknown function DUF2191  39.34 
 
 
68 aa  44.3  0.0006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.994089  normal  0.0127287 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0597  hypothetical protein  39.34 
 
 
68 aa  44.3  0.0006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0992352  normal  0.240372 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4985  Protein of unknown function DUF2191  42.62 
 
 
73 aa  42.4  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.494262  normal  0.887949 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1668  Protein of unknown function DUF2191  40.3 
 
 
81 aa  42  0.003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.283328  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0611  hypothetical protein  42.86 
 
 
65 aa  41.6  0.004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0196  hypothetical protein  33.87 
 
 
64 aa  41.2  0.005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0878  hypothetical protein  37.04 
 
 
65 aa  40  0.01  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00000140007  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>