22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_1883 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_1883  hypothetical protein  100 
 
 		 67 aa  130  6.999999999999999e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00517527  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0414  hypothetical protein  52.46 
 
 		 92 aa  71.6  0.000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2253  hypothetical protein  49.18 
 
 		 64 aa  71.2  0.000000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.381428  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0549  hypothetical protein  54.55 
 
 		 70 aa  71.2  0.000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0837  hypothetical protein  57.38 
 
 		 64 aa  71.2  0.000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.524341 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2528  hypothetical protein  49.18 
 
 		 64 aa  66.6  0.0000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3129  Protein of unknown function DUF2191  47.54 
 
 		 71 aa  59.3  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0231  hypothetical protein  40.32 
 
 		 67 aa  56.2  0.0000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.355276 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2434  hypothetical protein  40.62 
 
 		 67 aa  54.7  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0941492 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3709  hypothetical protein  45.9 
 
 		 70 aa  53.1  0.000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0707784 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1521  hypothetical protein  37.1 
 
 		 69 aa  51.6  0.000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1301  hypothetical protein  39.39 
 
 		 69 aa  50.4  0.000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00000150505  hitchhiker  0.00458479 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0684  hypothetical protein  32.26 
 
 		 66 aa  48.5  0.00003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000251429  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0375  hypothetical protein  34.43 
 
 		 66 aa  47  0.00008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.529371  normal  0.0790503 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1455  hypothetical protein  37.1 
 
 		 70 aa  45.8  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0196  hypothetical protein  36.07 
 
 		 64 aa  43.1  0.001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0878  hypothetical protein  27.42 
 
 		 65 aa  42.7  0.002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00000140007  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11135  hypothetical protein  38.78 
 
 		 65 aa  42  0.003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0947  hypothetical protein  39.29 
 
 		 66 aa  41.2  0.005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000156111  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6159  antitoxin of a toxin/antitoxin system  52.78 
 
 		 65 aa  41.2  0.005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4985  Protein of unknown function DUF2191  36.92 
 
 		 73 aa  40.8  0.006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.494262  normal  0.887949 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0702  hypothetical protein  38.46 
 
 		 66 aa  40  0.01  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>