23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_0231 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_0231  hypothetical protein  100 
 
 
67 aa  130  7.999999999999999e-30  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.355276 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1160  hypothetical protein  40.3 
 
 
70 aa  62.4  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0684  hypothetical protein  50.79 
 
 
66 aa  62  0.000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000251429  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3830  hypothetical protein  37.88 
 
 
70 aa  59.7  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1521  hypothetical protein  46.27 
 
 
69 aa  59.7  0.00000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2253  hypothetical protein  46.55 
 
 
64 aa  58.2  0.00000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.381428  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1883  hypothetical protein  40.32 
 
 
67 aa  56.2  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00517527  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0375  hypothetical protein  42.19 
 
 
66 aa  55.8  0.0000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.529371  normal  0.0790503 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0947  hypothetical protein  46.88 
 
 
66 aa  55.1  0.0000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000156111  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2528  hypothetical protein  44.83 
 
 
64 aa  53.9  0.0000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0878  hypothetical protein  42.86 
 
 
65 aa  53.9  0.0000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00000140007  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1455  hypothetical protein  38.81 
 
 
70 aa  53.9  0.0000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0414  hypothetical protein  44.83 
 
 
92 aa  53.5  0.000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3129  Protein of unknown function DUF2191  50 
 
 
71 aa  52.4  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0837  hypothetical protein  42.11 
 
 
64 aa  52.4  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.524341 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3709  hypothetical protein  45.16 
 
 
70 aa  50.1  0.000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0707784 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2434  hypothetical protein  42.11 
 
 
67 aa  47.8  0.00005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0941492 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0549  hypothetical protein  39.66 
 
 
70 aa  46.2  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1301  hypothetical protein  43.08 
 
 
69 aa  42  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00000150505  hitchhiker  0.00458479 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0702  hypothetical protein  40 
 
 
66 aa  41.2  0.005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0597  hypothetical protein  36.36 
 
 
68 aa  41.2  0.005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0992352  normal  0.240372 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0588  Protein of unknown function DUF2191  36.36 
 
 
68 aa  41.2  0.005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.994089  normal  0.0127287 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5720  hypothetical protein  40 
 
 
66 aa  40.8  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.175303  normal  0.62585 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>