32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_3709 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_3709  hypothetical protein  100 
 
 		 70 aa  140  6e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0707784 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1301  hypothetical protein  54.41 
 
 		 69 aa  73.9  0.0000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00000150505  hitchhiker  0.00458479 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0414  hypothetical protein  56.25 
 
 		 92 aa  64.3  0.0000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11592  hypothetical protein  52.24 
 
 		 72 aa  62  0.000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.305e-26  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2434  hypothetical protein  52.38 
 
 		 67 aa  60.8  0.000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0941492 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0549  hypothetical protein  48.57 
 
 		 70 aa  60.1  0.000000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2253  hypothetical protein  49.23 
 
 		 64 aa  57.8  0.00000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.381428  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2528  hypothetical protein  50.79 
 
 		 64 aa  55.8  0.0000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1883  hypothetical protein  45.9 
 
 		 67 aa  53.1  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00517527  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3129  Protein of unknown function DUF2191  43.66 
 
 		 71 aa  53.1  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0837  hypothetical protein  49.23 
 
 		 64 aa  52.8  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.524341 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4985  Protein of unknown function DUF2191  42.86 
 
 		 73 aa  52  0.000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.494262  normal  0.887949 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0231  hypothetical protein  45.16 
 
 		 67 aa  50.1  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.355276 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6159  antitoxin of a toxin/antitoxin system  58.14 
 
 		 65 aa  48.5  0.00003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6033  antitoxin of a toxin/antitoxin system  53.85 
 
 		 65 aa  46.6  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6100  antitoxin of a toxin/antitoxin system  55.81 
 
 		 78 aa  46.2  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.192956 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3924  hypothetical protein  55.81 
 
 		 65 aa  45.4  0.0002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.425499  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1668  Protein of unknown function DUF2191  45 
 
 		 81 aa  45.4  0.0003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.283328  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0611  hypothetical protein  53.49 
 
 		 65 aa  45.1  0.0004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0375  hypothetical protein  36.51 
 
 		 66 aa  43.5  0.0009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.529371  normal  0.0790503 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0330  hypothetical protein  51.16 
 
 		 65 aa  43.1  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4949  hypothetical protein  51.16 
 
 		 65 aa  42.4  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.398097  decreased coverage  0.00607131 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5319  hypothetical protein  51.16 
 
 		 65 aa  42.4  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.6152 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3047  hypothetical protein  51.16 
 
 		 65 aa  42.4  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.251694  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4105  hypothetical protein  44.23 
 
 		 112 aa  42.7  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.525193  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4678  hypothetical protein  51.16 
 
 		 78 aa  42  0.003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1290  hypothetical protein  48.84 
 
 		 65 aa  41.2  0.005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.5712  unclonable  0.000000000018273 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0230  hypothetical protein  48.84 
 
 		 65 aa  41.2  0.005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1579  hypothetical protein  48.84 
 
 		 65 aa  41.2  0.005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.045523  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0597  hypothetical protein  51.22 
 
 		 68 aa  40.4  0.007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0992352  normal  0.240372 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0588  Protein of unknown function DUF2191  51.22 
 
 		 68 aa  40.4  0.007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.994089  normal  0.0127287 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0947  hypothetical protein  37.1 
 
 		 66 aa  40.4  0.008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000156111  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>