30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_6100 on replicon NC_007971
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007971  Rmet_6100  antitoxin of a toxin/antitoxin system  100 
 
 		 78 aa  153  1e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.192956 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6033  antitoxin of a toxin/antitoxin system  93.65 
 
 		 65 aa  115  9.999999999999999e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6159  antitoxin of a toxin/antitoxin system  88.89 
 
 		 65 aa  111  4.0000000000000004e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3924  hypothetical protein  70.97 
 
 		 65 aa  84.3  5e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.425499  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3047  hypothetical protein  65.08 
 
 		 65 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.251694  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4949  hypothetical protein  65.08 
 
 		 65 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.398097  decreased coverage  0.00607131 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5319  hypothetical protein  65.08 
 
 		 65 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.6152 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4678  hypothetical protein  65.08 
 
 		 78 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0611  hypothetical protein  63.49 
 
 		 65 aa  82.4  0.000000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0330  hypothetical protein  65.08 
 
 		 65 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0230  hypothetical protein  62.3 
 
 		 65 aa  79.3  0.00000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1579  hypothetical protein  60.66 
 
 		 65 aa  78.6  0.00000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.045523  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1290  hypothetical protein  60.66 
 
 		 65 aa  78.2  0.00000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.5712  unclonable  0.000000000018273 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4801  hypothetical protein  53.97 
 
 		 70 aa  75.9  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.498712  normal  1 
 
 
-
 
NC_008761  Pnap_4803  hypothetical protein  60 
 
 		 68 aa  72  0.000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0192558  normal  0.0179772 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11135  hypothetical protein  55.56 
 
 		 65 aa  71.2  0.000000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5720  hypothetical protein  58.06 
 
 		 66 aa  71.2  0.000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.175303  normal  0.62585 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0702  hypothetical protein  53.97 
 
 		 66 aa  68.2  0.00000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0410  hypothetical protein  55.74 
 
 		 63 aa  68.2  0.00000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3864  hypothetical protein  52.38 
 
 		 99 aa  68.2  0.00000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.429086  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0631  hypothetical protein  57.14 
 
 		 68 aa  65.1  0.0000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5124  hypothetical protein  51.92 
 
 		 66 aa  57.4  0.00000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46620  hypothetical protein  47.62 
 
 		 68 aa  55.1  0.0000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0851  hypothetical protein  46.77 
 
 		 74 aa  52.4  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.631847  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0696  hypothetical protein  52.83 
 
 		 148 aa  50.4  0.000009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.387432  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5816  hypothetical protein  49.18 
 
 		 67 aa  50.1  0.00001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.595083  normal  0.267355 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3709  hypothetical protein  55.81 
 
 		 70 aa  46.2  0.0002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0707784 
 
 
-
 
NC_004632  PSPTO_B0074  hypothetical protein  40.32 
 
 		 66 aa  43.9  0.0007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.908723  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1301  hypothetical protein  43.42 
 
 		 69 aa  43.1  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00000150505  hitchhiker  0.00458479 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3129  Protein of unknown function DUF2191  39.06 
 
 		 71 aa  42  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>