24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_0410 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_0410  hypothetical protein  100 
 
 		 63 aa  121  3e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3864  hypothetical protein  70.49 
 
 		 99 aa  90.1  9e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.429086  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0330  hypothetical protein  61.29 
 
 		 65 aa  80.9  0.000000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3047  hypothetical protein  61.29 
 
 		 65 aa  80.5  0.000000000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.251694  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4678  hypothetical protein  61.29 
 
 		 78 aa  80.5  0.000000000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5319  hypothetical protein  61.29 
 
 		 65 aa  80.5  0.000000000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.6152 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4949  hypothetical protein  61.29 
 
 		 65 aa  80.5  0.000000000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.398097  decreased coverage  0.00607131 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0611  hypothetical protein  62.9 
 
 		 65 aa  80.1  0.000000000000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3924  hypothetical protein  61.29 
 
 		 65 aa  74.7  0.0000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.425499  normal  1 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6033  antitoxin of a toxin/antitoxin system  57.38 
 
 		 65 aa  69.7  0.00000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0230  hypothetical protein  52.46 
 
 		 65 aa  69.7  0.00000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1290  hypothetical protein  52.46 
 
 		 65 aa  69.7  0.00000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.5712  unclonable  0.000000000018273 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1579  hypothetical protein  52.46 
 
 		 65 aa  68.6  0.00000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.045523  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6100  antitoxin of a toxin/antitoxin system  55.74 
 
 		 78 aa  68.2  0.00000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.192956 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5720  hypothetical protein  53.23 
 
 		 66 aa  68.2  0.00000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.175303  normal  0.62585 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11135  hypothetical protein  50.82 
 
 		 65 aa  67  0.00000000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0702  hypothetical protein  50 
 
 		 66 aa  65.5  0.0000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4801  hypothetical protein  47.54 
 
 		 70 aa  63.5  0.0000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.498712  normal  1 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6159  antitoxin of a toxin/antitoxin system  50.82 
 
 		 65 aa  62  0.000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5124  hypothetical protein  52 
 
 		 66 aa  53.5  0.0000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008761  Pnap_4803  hypothetical protein  42.86 
 
 		 68 aa  47.8  0.00005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0192558  normal  0.0179772 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0631  hypothetical protein  42.86 
 
 		 68 aa  46.2  0.0002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46620  hypothetical protein  35.48 
 
 		 68 aa  43.1  0.001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3129  Protein of unknown function DUF2191  42.86 
 
 		 71 aa  43.1  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>