22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_0696 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_0696  hypothetical protein  100 
 
 		 148 aa  291  2e-78  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.387432  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4638  hypothetical protein  37.33 
 
 		 178 aa  76.3  0.0000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2267  hypothetical protein  40.74 
 
 		 140 aa  60.5  0.000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.257701  normal  0.627167 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1148  hypothetical protein  44.05 
 
 		 82 aa  56.6  0.0000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.16167  hitchhiker  0.00000208824 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0330  hypothetical protein  42.35 
 
 		 91 aa  55.8  0.0000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.610885  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11135  hypothetical protein  48.08 
 
 		 65 aa  53.1  0.000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6100  antitoxin of a toxin/antitoxin system  52.83 
 
 		 78 aa  50.4  0.000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.192956 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0611  hypothetical protein  50 
 
 		 65 aa  49.7  0.00001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6033  antitoxin of a toxin/antitoxin system  50 
 
 		 65 aa  48.9  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1290  hypothetical protein  45.45 
 
 		 65 aa  48.9  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.5712  unclonable  0.000000000018273 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1579  hypothetical protein  45.45 
 
 		 65 aa  49.3  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.045523  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5345  hypothetical protein  37.35 
 
 		 84 aa  48.5  0.00003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.629231 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0230  hypothetical protein  45.45 
 
 		 65 aa  48.1  0.00003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3924  hypothetical protein  48.15 
 
 		 65 aa  46.2  0.0002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.425499  normal  1 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6159  antitoxin of a toxin/antitoxin system  48.08 
 
 		 65 aa  45.4  0.0003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4678  hypothetical protein  44.9 
 
 		 78 aa  45.1  0.0004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3047  hypothetical protein  44.9 
 
 		 65 aa  44.3  0.0005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.251694  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5319  hypothetical protein  44.9 
 
 		 65 aa  44.3  0.0005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.6152 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4949  hypothetical protein  44.9 
 
 		 65 aa  44.3  0.0005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.398097  decreased coverage  0.00607131 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0330  hypothetical protein  42.86 
 
 		 65 aa  42.7  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4801  hypothetical protein  40.38 
 
 		 70 aa  42.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.498712  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3864  hypothetical protein  36.54 
 
 		 99 aa  41.6  0.004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.429086  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>