11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_2267 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_2267  hypothetical protein  100 
 
 		 140 aa  293  7e-79  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.257701  normal  0.627167 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4638  hypothetical protein  41.98 
 
 		 178 aa  64.7  0.0000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5345  hypothetical protein  39.29 
 
 		 84 aa  62.4  0.000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.629231 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0696  hypothetical protein  40.74 
 
 		 148 aa  60.5  0.000000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.387432  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0330  hypothetical protein  39.53 
 
 		 91 aa  58.2  0.00000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.610885  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1148  hypothetical protein  44.62 
 
 		 82 aa  58.5  0.00000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.16167  hitchhiker  0.00000208824 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0408  hypothetical protein  40.43 
 
 		 68 aa  45.1  0.0003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6957  hypothetical protein  32.93 
 
 		 85 aa  44.3  0.0006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.205707  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1130  hypothetical protein  40 
 
 		 89 aa  41.6  0.004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4537  hypothetical protein  32.14 
 
 		 90 aa  40.8  0.006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.980319  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0867  hypothetical protein  30.59 
 
 		 90 aa  40  0.01  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.835002  normal  0.557975 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>