12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_0867 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_0867  hypothetical protein  100 
 
 		 90 aa  182  9e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.835002  normal  0.557975 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4537  hypothetical protein  88.89 
 
 		 90 aa  164  4e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.980319  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0953  hypothetical protein  75.28 
 
 		 90 aa  139  9.999999999999999e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0453832  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6957  hypothetical protein  73.17 
 
 		 85 aa  128  2.0000000000000002e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.205707  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0767  hypothetical protein  69.32 
 
 		 90 aa  128  3e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.931407 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1130  hypothetical protein  68.54 
 
 		 89 aa  125  2.0000000000000002e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2959  hypothetical protein  64.04 
 
 		 87 aa  113  7.999999999999999e-25  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0763731  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0330  hypothetical protein  38.82 
 
 		 91 aa  55.1  0.0000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.610885  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1148  hypothetical protein  40 
 
 		 82 aa  54.3  0.0000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.16167  hitchhiker  0.00000208824 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5345  hypothetical protein  35 
 
 		 84 aa  45.8  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.629231 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4638  hypothetical protein  38.1 
 
 		 178 aa  43.5  0.0009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2267  hypothetical protein  30.59 
 
 		 140 aa  40  0.01  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.257701  normal  0.627167 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>