12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_0953 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_0953  hypothetical protein  100 
 
 		 90 aa  182  1.0000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0453832  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0867  hypothetical protein  75.28 
 
 		 90 aa  139  9.999999999999999e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.835002  normal  0.557975 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4537  hypothetical protein  71.59 
 
 		 90 aa  132  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.980319  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6957  hypothetical protein  69.51 
 
 		 85 aa  124  5e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.205707  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1130  hypothetical protein  66.29 
 
 		 89 aa  121  3e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0767  hypothetical protein  64.77 
 
 		 90 aa  120  5e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.931407 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2959  hypothetical protein  61.8 
 
 		 87 aa  111  3e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0763731  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0330  hypothetical protein  40.7 
 
 		 91 aa  60.8  0.000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.610885  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1148  hypothetical protein  42.5 
 
 		 82 aa  58.5  0.00000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.16167  hitchhiker  0.00000208824 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5345  hypothetical protein  40 
 
 		 84 aa  53.9  0.0000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.629231 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4638  hypothetical protein  39.76 
 
 		 178 aa  45.8  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0408  hypothetical protein  44.44 
 
 		 68 aa  43.9  0.0007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>