14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_1148 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_1148  hypothetical protein  100 
 
 
82 aa  170  5.999999999999999e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.16167  hitchhiker  0.00000208824 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0330  hypothetical protein  97.53 
 
 
91 aa  167  6e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.610885  normal 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5345  hypothetical protein  64.2 
 
 
84 aa  119  1.9999999999999998e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.629231 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1130  hypothetical protein  41.98 
 
 
89 aa  63.9  0.0000000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6957  hypothetical protein  41.25 
 
 
85 aa  62.4  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.205707  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0408  hypothetical protein  38.1 
 
 
68 aa  58.9  0.00000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2267  hypothetical protein  44.62 
 
 
140 aa  58.5  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.257701  normal  0.627167 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0953  hypothetical protein  42.5 
 
 
90 aa  58.5  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0453832  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4537  hypothetical protein  38.75 
 
 
90 aa  57.4  0.00000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.980319  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0696  hypothetical protein  44.05 
 
 
148 aa  56.6  0.0000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.387432  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2959  hypothetical protein  39.51 
 
 
87 aa  54.3  0.0000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0763731  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0867  hypothetical protein  40 
 
 
90 aa  54.3  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.835002  normal  0.557975 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0767  hypothetical protein  37.5 
 
 
90 aa  52.8  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.931407 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4638  hypothetical protein  47.69 
 
 
178 aa  47.8  0.00005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>