17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_2528 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013173  Dbac_2528  hypothetical protein  100 
 
 
64 aa  128  3e-29  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2253  hypothetical protein  67.21 
 
 
64 aa  86.7  9e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.381428  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0414  hypothetical protein  63.93 
 
 
92 aa  83.2  0.000000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0549  hypothetical protein  58.73 
 
 
70 aa  77.8  0.00000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0837  hypothetical protein  58.73 
 
 
64 aa  77.4  0.00000000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.524341 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1883  hypothetical protein  49.18 
 
 
67 aa  66.6  0.0000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00517527  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2434  hypothetical protein  52.63 
 
 
67 aa  58.5  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0941492 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3129  Protein of unknown function DUF2191  47.62 
 
 
71 aa  58.2  0.00000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3709  hypothetical protein  50.79 
 
 
70 aa  55.8  0.0000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0707784 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0231  hypothetical protein  44.83 
 
 
67 aa  53.9  0.0000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.355276 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0684  hypothetical protein  39.34 
 
 
66 aa  52.8  0.000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000251429  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0375  hypothetical protein  37.5 
 
 
66 aa  44.3  0.0006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.529371  normal  0.0790503 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4105  hypothetical protein  38.98 
 
 
112 aa  43.5  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.525193  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1301  hypothetical protein  41.27 
 
 
69 aa  43.1  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00000150505  hitchhiker  0.00458479 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1521  hypothetical protein  32.76 
 
 
69 aa  42.7  0.002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11592  hypothetical protein  41.27 
 
 
72 aa  42.4  0.002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.305e-26  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4985  Protein of unknown function DUF2191  40.32 
 
 
73 aa  41.6  0.003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.494262  normal  0.887949 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>