14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE0878 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002967  TDE0878  hypothetical protein  100 
 
 
65 aa  134  5e-31  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00000140007  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0947  hypothetical protein  55.56 
 
 
66 aa  74.7  0.0000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000156111  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0375  hypothetical protein  50.77 
 
 
66 aa  68.9  0.00000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.529371  normal  0.0790503 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1455  hypothetical protein  49.21 
 
 
70 aa  66.2  0.0000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3830  hypothetical protein  34.92 
 
 
70 aa  58.2  0.00000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0231  hypothetical protein  42.86 
 
 
67 aa  53.9  0.0000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.355276 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1160  hypothetical protein  31.75 
 
 
70 aa  52  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0684  hypothetical protein  39.68 
 
 
66 aa  51.2  0.000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000251429  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3129  Protein of unknown function DUF2191  41.51 
 
 
71 aa  50.8  0.000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1521  hypothetical protein  34.92 
 
 
69 aa  48.1  0.00004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4105  hypothetical protein  36.67 
 
 
112 aa  46.6  0.0001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.525193  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2253  hypothetical protein  32.76 
 
 
64 aa  43.1  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.381428  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1883  hypothetical protein  27.42 
 
 
67 aa  42.7  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00517527  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0414  hypothetical protein  37.04 
 
 
92 aa  40  0.01  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>