32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_1933 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_1933  hypothetical protein  100 
 
 		 315 aa  652    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0865  hypothetical protein  38.59 
 
 		 310 aa  195  1e-48  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.149678  normal  0.13788 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3609  hypothetical protein  35.55 
 
 		 351 aa  169  5e-41  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.285708 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0172  hypothetical protein  35.57 
 
 		 359 aa  164  2.0000000000000002e-39  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5647  hypothetical protein  35.54 
 
 		 346 aa  163  3e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.999402  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0442  hypothetical protein  37.33 
 
 		 347 aa  163  4.0000000000000004e-39  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.773186  normal  0.498356 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6583  hypothetical protein  34.84 
 
 		 346 aa  162  5.0000000000000005e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0167572 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3180  hypothetical protein  34.89 
 
 		 353 aa  155  9e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0794119 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3455  hypothetical protein  34.6 
 
 		 338 aa  155  1e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3314  hypothetical protein  34.04 
 
 		 346 aa  154  1e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.59573 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5963  hypothetical protein  34.53 
 
 		 356 aa  153  4e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0133958 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3957  hypothetical protein  31.03 
 
 		 325 aa  144  2e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.450887  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2624  hypothetical protein  30.69 
 
 		 325 aa  141  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5139  hypothetical protein  35.41 
 
 		 298 aa  137  2e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4811  hypothetical protein  30 
 
 		 509 aa  124  3e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2373  hypothetical protein  33.09 
 
 		 277 aa  120  3.9999999999999996e-26  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.780388  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4809  hypothetical protein  30.94 
 
 		 344 aa  119  9e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2574  hypothetical protein  32.2 
 
 		 300 aa  108  1e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00867  conserved hypothetical protein  31.72 
 
 		 366 aa  95.9  8e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.284571 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1780  hypothetical protein  30.71 
 
 		 264 aa  95.5  1e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.443384  normal  0.229108 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1017  hypothetical protein  36.94 
 
 		 255 aa  89.7  6e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  decreased coverage  0.00283953  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_30337  conserved hypothetical protein  23.17 
 
 		 442 aa  87.8  2e-16  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.18618 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04122  conserved hypothetical protein  30.26 
 
 		 418 aa  87.8  2e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.717308 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10123  conserved hypothetical protein  28.03 
 
 		 433 aa  87.4  3e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04673  conserved hypothetical protein  26.62 
 
 		 489 aa  77.8  0.0000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_58975  predicted protein  25.59 
 
 		 396 aa  77.4  0.0000000000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.790136  normal  0.237015 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_32780  predicted protein  26.84 
 
 		 422 aa  72  0.00000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02881  conserved hypothetical protein  34.15 
 
 		 441 aa  68.9  0.0000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.406918 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1963  hypothetical protein  27.96 
 
 		 317 aa  64.3  0.000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.435918  normal  0.990238 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2221  hypothetical protein  30 
 
 		 291 aa  62.8  0.000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.853189  normal  0.634217 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1054  hypothetical protein  30.16 
 
 		 145 aa  48.5  0.0002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.657724  normal  0.456206 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_52502  predicted protein  24.88 
 
 		 337 aa  47.4  0.0003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0548873  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>