30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_1017 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008044  TM1040_1017  hypothetical protein  100 
 
 		 255 aa  518  1e-146  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  decreased coverage  0.00283953  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1780  hypothetical protein  47.41 
 
 		 264 aa  208  9e-53  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.443384  normal  0.229108 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5139  hypothetical protein  34.57 
 
 		 298 aa  115  6.9999999999999995e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2373  hypothetical protein  34.62 
 
 		 277 aa  103  2e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.780388  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2574  hypothetical protein  28.76 
 
 		 300 aa  95.1  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1933  hypothetical protein  36.94 
 
 		 315 aa  89.7  4e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04673  conserved hypothetical protein  27.6 
 
 		 489 aa  85.5  8e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_30337  conserved hypothetical protein  25.49 
 
 		 442 aa  75.9  0.0000000000005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.18618 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0865  hypothetical protein  35.9 
 
 		 310 aa  74.3  0.000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.149678  normal  0.13788 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5647  hypothetical protein  26.12 
 
 		 346 aa  71.6  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.999402  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3314  hypothetical protein  25.39 
 
 		 346 aa  71.2  0.00000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.59573 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10123  conserved hypothetical protein  26.62 
 
 		 433 aa  70.9  0.00000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_58975  predicted protein  21.79 
 
 		 396 aa  70.1  0.00000000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.790136  normal  0.237015 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6583  hypothetical protein  26.45 
 
 		 346 aa  70.1  0.00000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0167572 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00867  conserved hypothetical protein  24.33 
 
 		 366 aa  67  0.0000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.284571 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3180  hypothetical protein  25.83 
 
 		 353 aa  64.7  0.000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0794119 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0442  hypothetical protein  28.57 
 
 		 347 aa  63.2  0.000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.773186  normal  0.498356 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02881  conserved hypothetical protein  27.01 
 
 		 441 aa  62.8  0.000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.406918 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3609  hypothetical protein  28.3 
 
 		 351 aa  61.6  0.00000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.285708 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_32780  predicted protein  24.48 
 
 		 422 aa  60.5  0.00000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5963  hypothetical protein  23.9 
 
 		 356 aa  58.5  0.00000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0133958 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3455  hypothetical protein  25.71 
 
 		 338 aa  58.2  0.0000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0172  hypothetical protein  26.98 
 
 		 359 aa  57.4  0.0000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04122  conserved hypothetical protein  29.05 
 
 		 418 aa  55.8  0.0000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.717308 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4809  hypothetical protein  29.87 
 
 		 344 aa  51.6  0.00001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2624  hypothetical protein  27.56 
 
 		 325 aa  51.2  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_52502  predicted protein  25.97 
 
 		 337 aa  49.7  0.00004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0548873  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3957  hypothetical protein  28.03 
 
 		 325 aa  46.6  0.0004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.450887  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2221  hypothetical protein  29.77 
 
 		 291 aa  45.8  0.0007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.853189  normal  0.634217 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1963  hypothetical protein  31.67 
 
 		 317 aa  43.5  0.003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.435918  normal  0.990238 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>